More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2818 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  100 
 
 		 463 aa  884    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  65.12 
 
 		 463 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.73 
 
 		 452 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 468 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 468 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  50 
 
 		 468 aa  362  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  53.74 
 
 		 397 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  42.37 
 
 		 469 aa  289  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 523 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  45.22 
 
 		 494 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 		 457 aa  270  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 479 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.29 
 
 		 478 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 488 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 488 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.95 
 
 		 478 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.56 
 
 		 522 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.9 
 
 		 478 aa  256  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2073  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  40.44 
 
 		 561 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132683  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  38.7 
 
 		 511 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  39.87 
 
 		 511 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1425  putative methylenomycin A resistance protein  39.65 
 
 		 511 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2189  putative methylenomycin A resistance protein  39.65 
 
 		 511 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.969114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.24 
 
 		 480 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 480 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.05 
 
 		 488 aa  246  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 455 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 		 486 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 		 486 aa  243  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 		 486 aa  243  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 		 486 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 		 486 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 		 486 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.22 
 
 		 458 aa  242  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.32 
 
 		 478 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.32 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.32 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 469 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 474 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0408  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 		 487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.417643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.05 
 
 		 508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 		 502 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.78 
 
 		 505 aa  233  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  40.05 
 
 		 450 aa  232  9e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.67 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.39 
 
 		 489 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.26 
 
 		 524 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.62 
 
 		 466 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.14 
 
 		 510 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.32 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 483 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.54 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.39 
 
 		 490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  37.59 
 
 		 467 aa  221  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.74 
 
 		 529 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.62 
 
 		 476 aa  217  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.68 
 
 		 469 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.02 
 
 		 763 aa  217  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  36.45 
 
 		 537 aa  216  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.88 
 
 		 502 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.58 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.17 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.54 
 
 		 489 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  35.15 
 
 		 523 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.47 
 
 		 522 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2508  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 472 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.3 
 
 		 458 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 		 485 aa  206  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 		 528 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.15 
 
 		 520 aa  203  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.54 
 
 		 524 aa  202  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.71 
 
 		 488 aa  202  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.83 
 
 		 534 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.56 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.54 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.29 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.72 
 
 		 525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.66 
 
 		 583 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  37.37 
 
 		 497 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.35 
 
 		 471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.54 
 
 		 527 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  35.82 
 
 		 492 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.76 
 
 		 520 aa  197  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 		 506 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.39 
 
 		 522 aa  197  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 		 506 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.65 
 
 		 542 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  35.78 
 
 		 582 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.64 
 
 		 505 aa  195  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.61 
 
 		 509 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 553 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.93 
 
 		 500 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  33.81 
 
 		 530 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>