More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6387 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  100 
 
 		 480 aa  904    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  95.03 
 
 		 483 aa  811    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  95.03 
 
 		 483 aa  811    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  45.67 
 
 		 523 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 479 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 		 494 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  42.04 
 
 		 511 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 477 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  42.04 
 
 		 511 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  41.77 
 
 		 514 aa  289  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1425  putative methylenomycin A resistance protein  41.83 
 
 		 511 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.61 
 
 		 452 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2189  putative methylenomycin A resistance protein  41.83 
 
 		 511 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.969114  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44.3 
 
 		 469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2073  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  42.76 
 
 		 561 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132683  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 468 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 468 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  43.26 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 463 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 474 aa  256  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 		 463 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.87 
 
 		 480 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  40.36 
 
 		 483 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 468 aa  243  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0408  major facilitator superfamily MFS_1  44.04 
 
 		 487 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.417643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.2 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.58 
 
 		 522 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  39.85 
 
 		 450 aa  223  6e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.09 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.18 
 
 		 469 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.47 
 
 		 458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.68 
 
 		 478 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.92 
 
 		 478 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.92 
 
 		 484 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.65 
 
 		 478 aa  213  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.62 
 
 		 522 aa  213  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.27 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.1 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 476 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.45 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 476 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.45 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.45 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.65 
 
 		 505 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.29 
 
 		 489 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.45 
 
 		 486 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.45 
 
 		 486 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.45 
 
 		 486 aa  209  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 476 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.24 
 
 		 516 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.59 
 
 		 490 aa  207  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.88 
 
 		 508 aa  207  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  35.45 
 
 		 523 aa  206  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.83 
 
 		 502 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1455  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 443 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  36.93 
 
 		 537 aa  202  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.58 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.24 
 
 		 458 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.97 
 
 		 489 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2892  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 477 aa  199  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.78 
 
 		 492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1585  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 		 492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.6 
 
 		 488 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5226  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.59 
 
 		 488 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.2 
 
 		 542 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.55 
 
 		 506 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 		 506 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.35 
 
 		 506 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 		 506 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.59 
 
 		 510 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8037  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 463 aa  193  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4075  MFS family transporter  37.84 
 
 		 513 aa  193  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.31 
 
 		 478 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5842  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 456 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  36.3 
 
 		 1065 aa  189  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.68 
 
 		 520 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  35.8 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 490 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.22 
 
 		 534 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  34.29 
 
 		 467 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.18 
 
 		 522 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.97 
 
 		 763 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.45 
 
 		 509 aa  186  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.59 
 
 		 486 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47230  putative MFS transporter  37.5 
 
 		 513 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 		 512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6648  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.31 
 
 		 525 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.54 
 
 		 478 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.41 
 
 		 483 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.56 
 
 		 539 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6246  major facilitator transporter  40.39 
 
 		 465 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>