More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0408 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0408  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
487 aa  917    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.417643 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  45.13 
 
 
457 aa  342  5.999999999999999e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  46.03 
 
 
469 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1585  major facilitator superfamily MFS_1  46.73 
 
 
492 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  46.14 
 
 
480 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  46.96 
 
 
477 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  40.8 
 
 
463 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  42.27 
 
 
494 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  45.37 
 
 
483 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  45.37 
 
 
483 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  44.55 
 
 
482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  40.34 
 
 
511 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  40.47 
 
 
514 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  40.34 
 
 
511 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2073  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  40.72 
 
 
561 aa  250  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132683  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  42.86 
 
 
523 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1425  putative methylenomycin A resistance protein  40.13 
 
 
511 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2189  putative methylenomycin A resistance protein  40.13 
 
 
511 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.969114  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 
463 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.32 
 
 
452 aa  247  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  44.03 
 
 
488 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  44.03 
 
 
488 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  44.03 
 
 
479 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 
483 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  39.72 
 
 
468 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  39.72 
 
 
468 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.75 
 
 
480 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  38.73 
 
 
474 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  44.14 
 
 
455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2720  drug:proton antiporter  44.31 
 
 
337 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.48 
 
 
478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  39.22 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.14 
 
 
522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.27 
 
 
502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.14 
 
 
490 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.76 
 
 
489 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
505 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  41.9 
 
 
397 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  39.35 
 
 
468 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  38.57 
 
 
469 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.39 
 
 
763 aa  206  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.95 
 
 
506 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.95 
 
 
506 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.24 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.91 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  38.28 
 
 
490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.23 
 
 
506 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8037  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 
463 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 
502 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.45 
 
 
506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  38.33 
 
 
537 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  38.55 
 
 
476 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  37.96 
 
 
476 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  37.96 
 
 
476 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.48 
 
 
493 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.35 
 
 
476 aa  193  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.11 
 
 
485 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.05 
 
 
488 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.63 
 
 
524 aa  191  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.41 
 
 
478 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.36 
 
 
478 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.29 
 
 
471 aa  190  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.17 
 
 
510 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.54 
 
 
490 aa  189  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.23 
 
 
500 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.59 
 
 
519 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 
520 aa  188  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.99 
 
 
522 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.72 
 
 
532 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 
478 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  33.18 
 
 
523 aa  186  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.25 
 
 
478 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.25 
 
 
484 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.38 
 
 
500 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 
529 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.18 
 
 
487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 
524 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.71 
 
 
488 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.4 
 
 
489 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.9 
 
 
474 aa  182  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.61 
 
 
522 aa  182  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  36.26 
 
 
457 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47230  putative MFS transporter  38.44 
 
 
513 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  33.85 
 
 
497 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 
487 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.58 
 
 
534 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.34 
 
 
508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.41 
 
 
520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4075  MFS family transporter  38.44 
 
 
513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 
508 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.71 
 
 
469 aa  180  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.59 
 
 
540 aa  179  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.79 
 
 
509 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.12 
 
 
472 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.29 
 
 
498 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.15 
 
 
492 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 
480 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  33.67 
 
 
483 aa  177  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.64 
 
 
512 aa  176  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.06 
 
 
527 aa  176  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>