More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4342 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
520 aa  1009    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.92 
 
 
531 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.29 
 
 
534 aa  314  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  39.38 
 
 
520 aa  300  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.11 
 
 
532 aa  293  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.83 
 
 
525 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.71 
 
 
532 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.55 
 
 
503 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.54 
 
 
522 aa  280  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.83 
 
 
502 aa  279  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.07 
 
 
524 aa  277  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.61 
 
 
522 aa  277  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  39.18 
 
 
519 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.79 
 
 
538 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.4 
 
 
528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  39.22 
 
 
533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  39.9 
 
 
509 aa  272  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.07 
 
 
626 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.4 
 
 
607 aa  263  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 
528 aa  262  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.81 
 
 
485 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  37.15 
 
 
525 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  37.15 
 
 
525 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  37.15 
 
 
525 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 
503 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  37.12 
 
 
502 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 
509 aa  253  6e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.52 
 
 
489 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.29 
 
 
525 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7431  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 
533 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.7 
 
 
478 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 
519 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 
516 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.21 
 
 
480 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.6 
 
 
486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.6 
 
 
486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.6 
 
 
486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.6 
 
 
486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  35.61 
 
 
530 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.6 
 
 
486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.6 
 
 
486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 
511 aa  243  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.04 
 
 
522 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.18 
 
 
510 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  32.95 
 
 
526 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 
517 aa  240  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 
478 aa  239  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.68 
 
 
489 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.3 
 
 
478 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.3 
 
 
484 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.52 
 
 
488 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.05 
 
 
478 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  39.61 
 
 
507 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 
588 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.62 
 
 
478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
516 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  33.27 
 
 
518 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.78 
 
 
487 aa  230  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 
452 aa  230  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 
458 aa  230  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.52 
 
 
478 aa  229  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  33.66 
 
 
532 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.87 
 
 
520 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6678  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 
523 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519624  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2542  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
485 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.44 
 
 
540 aa  227  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
519 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.79 
 
 
534 aa  226  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.41 
 
 
520 aa  226  8e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 
555 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.63 
 
 
534 aa  226  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.92 
 
 
476 aa  225  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  34.1 
 
 
537 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  36.94 
 
 
554 aa  223  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
513 aa  223  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 
517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 
521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.05 
 
 
466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.93 
 
 
537 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.37 
 
 
488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.77 
 
 
525 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.76 
 
 
514 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  35.7 
 
 
535 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 
562 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  34.94 
 
 
468 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  34.94 
 
 
468 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 
508 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.1 
 
 
539 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  34.15 
 
 
463 aa  218  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 
524 aa  217  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2493  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 
517 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000001804  hitchhiker  0.00137453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.06 
 
 
529 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3341  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  34.92 
 
 
509 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  34.22 
 
 
528 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.45 
 
 
646 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.45 
 
 
646 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  35.37 
 
 
528 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 
500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  33.2 
 
 
513 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>