More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9051 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  100 
 
 		 509 aa  968    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  69.38 
 
 		 508 aa  601  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  66.95 
 
 		 516 aa  545  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  58.66 
 
 		 540 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  52.99 
 
 		 526 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  51.49 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  47.94 
 
 		 528 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  50.58 
 
 		 558 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  50.81 
 
 		 521 aa  412  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  48.24 
 
 		 524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  49.51 
 
 		 517 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 		 518 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  47.65 
 
 		 536 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  48.09 
 
 		 501 aa  395  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  53.14 
 
 		 481 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  52.55 
 
 		 496 aa  392  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  52.63 
 
 		 539 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  45.73 
 
 		 562 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  46.27 
 
 		 529 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  53.55 
 
 		 502 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  44.81 
 
 		 516 aa  363  4e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  45.93 
 
 		 528 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  47.69 
 
 		 575 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  45.58 
 
 		 509 aa  352  8e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  48.12 
 
 		 588 aa  347  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  44.38 
 
 		 553 aa  346  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.66 
 
 		 537 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  44.18 
 
 		 519 aa  343  4e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  48.51 
 
 		 528 aa  340  5e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 		 509 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  42.83 
 
 		 509 aa  336  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 		 535 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 514 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  41.83 
 
 		 541 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  45.73 
 
 		 521 aa  330  4e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  44.11 
 
 		 525 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  44.11 
 
 		 525 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  44.11 
 
 		 525 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  44.63 
 
 		 513 aa  326  8.000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  44.04 
 
 		 554 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 		 555 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  43.2 
 
 		 505 aa  323  4e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 532 aa  323  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  48.64 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  44.09 
 
 		 524 aa  318  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  48.13 
 
 		 563 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  45.36 
 
 		 497 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  44.13 
 
 		 601 aa  307  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  43.95 
 
 		 506 aa  306  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  42.74 
 
 		 503 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 584 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  42.77 
 
 		 513 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 		 514 aa  300  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 533 aa  299  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  44.93 
 
 		 508 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  39.08 
 
 		 490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  44.97 
 
 		 536 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  40.4 
 
 		 535 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  38.24 
 
 		 492 aa  264  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  40.64 
 
 		 516 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  41.89 
 
 		 517 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 		 516 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 		 516 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 		 517 aa  243  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  36.44 
 
 		 504 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  37.52 
 
 		 510 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  41.72 
 
 		 528 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  36.4 
 
 		 500 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 		 500 aa  232  9e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 503 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 		 511 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 520 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 		 538 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.23 
 
 		 522 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  39 
 
 		 594 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.8 
 
 		 534 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  36.53 
 
 		 513 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.49 
 
 		 525 aa  216  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 514 aa  216  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 515 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.97 
 
 		 503 aa  212  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  35.49 
 
 		 501 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 		 506 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 519 aa  206  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32 
 
 		 607 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.92 
 
 		 520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.55 
 
 		 626 aa  199  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  36.36 
 
 		 501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.6 
 
 		 532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 		 519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 		 524 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.11 
 
 		 531 aa  197  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 509 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 501 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 		 507 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  35.61 
 
 		 502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 		 501 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>