More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0051 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
509 aa  984    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  59.84 
 
 
528 aa  532  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  60.88 
 
 
554 aa  529  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  53.51 
 
 
516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  58.92 
 
 
524 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  56.43 
 
 
588 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  52.39 
 
 
532 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  53.23 
 
 
519 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  56.1 
 
 
505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  52.95 
 
 
513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  56.54 
 
 
536 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  49.51 
 
 
517 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 
562 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  49.2 
 
 
533 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  49.59 
 
 
525 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  49.59 
 
 
525 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  49.59 
 
 
525 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 
501 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  44.93 
 
 
524 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  44.83 
 
 
529 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  46.38 
 
 
521 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  45.76 
 
 
528 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  45.28 
 
 
513 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  49.37 
 
 
535 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 
518 aa  354  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  44.56 
 
 
509 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  46.58 
 
 
508 aa  347  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  45.8 
 
 
575 aa  347  4e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.62 
 
 
537 aa  347  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  43.42 
 
 
526 aa  346  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 
553 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  43 
 
 
558 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  47.52 
 
 
524 aa  335  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  42.74 
 
 
555 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  47.65 
 
 
563 aa  333  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  42.94 
 
 
584 aa  333  6e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  41.79 
 
 
509 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  40.85 
 
 
514 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  43.94 
 
 
536 aa  330  4e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 
496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 
541 aa  325  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  43.9 
 
 
540 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  43.57 
 
 
601 aa  323  5e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  44.8 
 
 
521 aa  323  5e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  45.11 
 
 
481 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  43.22 
 
 
539 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  44.75 
 
 
516 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  40.37 
 
 
509 aa  316  7e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  42.44 
 
 
508 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  46.33 
 
 
506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  39.68 
 
 
517 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 
535 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  45.61 
 
 
528 aa  307  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 
502 aa  306  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 
513 aa  302  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  42.12 
 
 
517 aa  302  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  45.32 
 
 
477 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  37.61 
 
 
490 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 
511 aa  294  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 
503 aa  288  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 
516 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  40.88 
 
 
514 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  42.14 
 
 
497 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  39.61 
 
 
494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  39.22 
 
 
504 aa  273  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.04 
 
 
534 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  39.96 
 
 
500 aa  269  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.69 
 
 
538 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 
520 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  38.59 
 
 
492 aa  266  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  40.98 
 
 
528 aa  266  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  38.64 
 
 
513 aa  263  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  37.34 
 
 
503 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  40.48 
 
 
516 aa  259  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.95 
 
 
522 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.5 
 
 
503 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 
501 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 
500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 
510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  36.72 
 
 
495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  37.15 
 
 
495 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.28 
 
 
519 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 
500 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  37.15 
 
 
495 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  37.15 
 
 
495 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  37.15 
 
 
495 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.4 
 
 
532 aa  253  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  37.8 
 
 
502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.68 
 
 
607 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  36.72 
 
 
519 aa  243  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.34 
 
 
626 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  39.28 
 
 
514 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  40.76 
 
 
501 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 
507 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.24 
 
 
525 aa  240  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  40.04 
 
 
501 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  36.45 
 
 
495 aa  239  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2153  major facilitator superfamily MFS_1  37.45 
 
 
510 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 
516 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0717  major facilitator superfamily transporter  37.32 
 
 
510 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>