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for query gene Sros_6960 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
528 aa  1027    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.67 
 
 
532 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.58 
 
 
524 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.89 
 
 
520 aa  399  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  43.06 
 
 
530 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  42.97 
 
 
522 aa  350  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.92 
 
 
529 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.01 
 
 
522 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.79 
 
 
520 aa  259  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.97 
 
 
478 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.39 
 
 
488 aa  254  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.51 
 
 
512 aa  250  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 
505 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 
520 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.15 
 
 
534 aa  247  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.65 
 
 
489 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.73 
 
 
509 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  35.61 
 
 
467 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.19 
 
 
478 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.12 
 
 
525 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34 
 
 
534 aa  238  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.91 
 
 
510 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 
607 aa  237  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.02 
 
 
646 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.02 
 
 
646 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.02 
 
 
646 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.36 
 
 
540 aa  236  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.84 
 
 
468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.74 
 
 
521 aa  235  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.03 
 
 
493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5607  drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  37.41 
 
 
475 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864613  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.61 
 
 
522 aa  234  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.09 
 
 
534 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.47 
 
 
763 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.96 
 
 
609 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.48 
 
 
532 aa  231  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 
502 aa  230  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.13 
 
 
546 aa  227  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.26 
 
 
527 aa  226  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.96 
 
 
478 aa  226  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.44 
 
 
511 aa  225  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.31 
 
 
478 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  36.7 
 
 
490 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.31 
 
 
478 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.31 
 
 
484 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 
519 aa  225  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.27 
 
 
487 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.48 
 
 
478 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.22 
 
 
475 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 
498 aa  223  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
627 aa  223  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.48 
 
 
502 aa  223  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.79 
 
 
500 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.8 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.01 
 
 
626 aa  221  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
509 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.94 
 
 
498 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.14 
 
 
522 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 
517 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 
528 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.3 
 
 
500 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.19 
 
 
487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.12 
 
 
538 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 
504 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  32.88 
 
 
519 aa  217  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.02 
 
 
478 aa  216  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  36.3 
 
 
537 aa  216  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.77 
 
 
489 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  32.39 
 
 
579 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  30.36 
 
 
537 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.8 
 
 
520 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 
465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  30.16 
 
 
511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.91 
 
 
518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 
509 aa  214  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  30.36 
 
 
537 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.44 
 
 
583 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32 
 
 
531 aa  213  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.66 
 
 
469 aa  213  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.28 
 
 
494 aa  213  9e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.08 
 
 
583 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.64 
 
 
477 aa  213  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.67 
 
 
514 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.77 
 
 
519 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  33.97 
 
 
509 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  34.17 
 
 
554 aa  210  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 
542 aa  210  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.13 
 
 
477 aa  210  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.97 
 
 
503 aa  209  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.44 
 
 
579 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.61 
 
 
474 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.58 
 
 
537 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 
486 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 
486 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 
486 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 
486 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
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NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 
486 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
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NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 
486 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  29.77 
 
 
537 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.74 
 
 
471 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
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