More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2370 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 520 aa  985    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.04 
 
 		 583 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.18 
 
 		 542 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.16 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.04 
 
 		 539 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.83 
 
 		 502 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50 
 
 		 504 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.63 
 
 		 516 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.35 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.35 
 
 		 500 aa  298  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.42 
 
 		 522 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.19 
 
 		 500 aa  286  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.74 
 
 		 529 aa  286  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.93 
 
 		 486 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.28 
 
 		 492 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  43.34 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2240  major facilitator superfamily MFS_1  45.27 
 
 		 463 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.14 
 
 		 489 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 465 aa  264  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.65 
 
 		 498 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0982  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.01 
 
 		 497 aa  259  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0976  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.78 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3231  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.19 
 
 		 479 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.28 
 
 		 613 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.44 
 
 		 478 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.05 
 
 		 483 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 469 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.55 
 
 		 510 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.66 
 
 		 522 aa  238  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.58 
 
 		 502 aa  236  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.44 
 
 		 488 aa  236  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40 
 
 		 489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 476 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 476 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 468 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 468 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 		 546 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.28 
 
 		 528 aa  227  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.84 
 
 		 520 aa  226  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.52 
 
 		 468 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.82 
 
 		 534 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.22 
 
 		 504 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  37.41 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.32 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.62 
 
 		 485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.22 
 
 		 469 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 		 498 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.24 
 
 		 480 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.8 
 
 		 489 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.1 
 
 		 478 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.16 
 
 		 540 aa  217  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.24 
 
 		 522 aa  216  8e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.23 
 
 		 607 aa  216  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.31 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.94 
 
 		 524 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.02 
 
 		 487 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.11 
 
 		 505 aa  213  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 483 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.99 
 
 		 521 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.38 
 
 		 490 aa  211  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.52 
 
 		 478 aa  209  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.44 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.18 
 
 		 509 aa  209  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.49 
 
 		 458 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 		 763 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 520 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  38.02 
 
 		 470 aa  207  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 528 aa  206  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  40 
 
 		 468 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.17 
 
 		 506 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.17 
 
 		 506 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.63 
 
 		 525 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  35.46 
 
 		 579 aa  206  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.17 
 
 		 506 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.29 
 
 		 487 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.22 
 
 		 512 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.08 
 
 		 522 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 		 529 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 486 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 486 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 486 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.14 
 
 		 506 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 486 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 486 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 486 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 505 aa  203  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 		 507 aa  203  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 458 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.68 
 
 		 493 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.26 
 
 		 534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
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NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.21 
 
 		 490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.19 
 
 		 534 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
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NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 519 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.1 
 
 		 697 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
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