More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2238 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 525 aa  1020    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 517 aa  353  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.34 
 
 		 518 aa  321  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 520 aa  289  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.04 
 
 		 534 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.47 
 
 		 522 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.66 
 
 		 520 aa  263  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.83 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.38 
 
 		 522 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 503 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.34 
 
 		 519 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.26 
 
 		 503 aa  249  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.63 
 
 		 525 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 519 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.53 
 
 		 532 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.75 
 
 		 525 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 528 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 		 509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.07 
 
 		 626 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 555 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.8 
 
 		 524 aa  229  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 538 aa  229  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 		 507 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 562 aa  226  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  35.69 
 
 		 554 aa  225  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  37.16 
 
 		 502 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 517 aa  223  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.91 
 
 		 534 aa  223  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 514 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 		 528 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2521  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 497 aa  220  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.48 
 
 		 532 aa  219  8.999999999999998e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 553 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  40.09 
 
 		 513 aa  217  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.35 
 
 		 468 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 528 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.04 
 
 		 505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.94 
 
 		 531 aa  213  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.07 
 
 		 486 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.39 
 
 		 607 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 588 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.25 
 
 		 551 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 521 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.45 
 
 		 489 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 		 516 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.75 
 
 		 537 aa  212  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 533 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6678  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 		 523 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.83 
 
 		 541 aa  209  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.51 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 521 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.75 
 
 		 488 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 519 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.4 
 
 		 522 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 500 aa  207  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.31 
 
 		 520 aa  207  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  35.98 
 
 		 517 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33 
 
 		 478 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.78 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 		 502 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 526 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 		 541 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 525 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  32.87 
 
 		 525 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 525 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 518 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 500 aa  204  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 509 aa  204  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  35.87 
 
 		 528 aa  203  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 505 aa  204  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.44 
 
 		 489 aa  203  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.18 
 
 		 476 aa  202  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 541 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 508 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 		 516 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.54 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 		 545 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.31 
 
 		 490 aa  199  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  32.27 
 
 		 467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.66 
 
 		 469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.29 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.6 
 
 		 506 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7431  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 533 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.9 
 
 		 500 aa  196  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  33.4 
 
 		 535 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.45 
 
 		 478 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 540 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.55 
 
 		 519 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.52 
 
 		 510 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.53 
 
 		 506 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.53 
 
 		 506 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.44 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>