More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2521 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2521  major facilitator transporter  100 
 
 		 497 aa  954    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 503 aa  263  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.3 
 
 		 534 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.7 
 
 		 519 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 520 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 507 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.32 
 
 		 518 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.81 
 
 		 522 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.26 
 
 		 607 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.41 
 
 		 525 aa  233  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34 
 
 		 528 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.65 
 
 		 525 aa  229  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  38.26 
 
 		 502 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.44 
 
 		 532 aa  227  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 		 522 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.87 
 
 		 626 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.19 
 
 		 503 aa  219  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 		 532 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.69 
 
 		 524 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.78 
 
 		 486 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.78 
 
 		 486 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.78 
 
 		 486 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.78 
 
 		 486 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.78 
 
 		 486 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.78 
 
 		 486 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 517 aa  213  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 533 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 525 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  35.27 
 
 		 525 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.95 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 525 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.11 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 517 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.1 
 
 		 522 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.6 
 
 		 520 aa  206  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.06 
 
 		 531 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7431  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 533 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 484 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 502 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.25 
 
 		 478 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.65 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 511 aa  200  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.51 
 
 		 534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.72 
 
 		 520 aa  197  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 516 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.9 
 
 		 488 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 		 498 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 562 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.97 
 
 		 529 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  35.22 
 
 		 517 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.41 
 
 		 505 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 500 aa  190  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 528 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 		 508 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 		 537 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  35.11 
 
 		 528 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.08 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 500 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 469 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.35 
 
 		 493 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 494 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  34.62 
 
 		 535 aa  186  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 521 aa  186  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  31.72 
 
 		 530 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.12 
 
 		 485 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.2 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.63 
 
 		 538 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.63 
 
 		 489 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 463 aa  184  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 588 aa  183  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 529 aa  183  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 516 aa  183  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 474 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 555 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.81 
 
 		 478 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 485 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 528 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6678  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 523 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.17 
 
 		 480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 518 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.17 
 
 		 763 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.14 
 
 		 505 aa  179  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  37.46 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.48 
 
 		 534 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 516 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  33.48 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.09 
 
 		 458 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 		 521 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30480  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.38 
 
 		 559 aa  177  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 513 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>