More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4282 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  92.8 
 
 		 500 aa  874    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 500 aa  981    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  64.5 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  54.51 
 
 		 500 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  57.23 
 
 		 495 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  56.87 
 
 		 504 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  56.25 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  56.47 
 
 		 501 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  50.3 
 
 		 503 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  46.42 
 
 		 594 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 		 517 aa  327  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  46.35 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 		 496 aa  322  7e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  48.32 
 
 		 501 aa  315  9e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 525 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  39.76 
 
 		 525 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 525 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 533 aa  312  9e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  40.49 
 
 		 513 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 		 523 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  40.4 
 
 		 495 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  40.4 
 
 		 495 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  40.4 
 
 		 495 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  40.4 
 
 		 495 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0717  major facilitator superfamily transporter  45.56 
 
 		 510 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  40.2 
 
 		 495 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  44.47 
 
 		 517 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 		 528 aa  294  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  38.88 
 
 		 516 aa  293  7e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 		 511 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.49 
 
 		 537 aa  290  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2153  major facilitator superfamily MFS_1  43.95 
 
 		 510 aa  289  9e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  40.49 
 
 		 535 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  39.78 
 
 		 588 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  39.46 
 
 		 494 aa  287  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  39.79 
 
 		 528 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  38.65 
 
 		 516 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  43.74 
 
 		 528 aa  279  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 562 aa  277  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 526 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 		 555 aa  273  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 		 510 aa  270  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 		 508 aa  267  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  40.3 
 
 		 505 aa  264  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  37.58 
 
 		 509 aa  263  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 519 aa  263  6e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  38 
 
 		 508 aa  262  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 521 aa  260  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 524 aa  259  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  37.79 
 
 		 517 aa  258  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  38.12 
 
 		 554 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 		 477 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 520 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 509 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 521 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 558 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 529 aa  250  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 541 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 514 aa  249  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.71 
 
 		 525 aa  247  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  36.16 
 
 		 501 aa  246  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 535 aa  246  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 490 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 540 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 532 aa  243  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 575 aa  242  9e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  39.92 
 
 		 511 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 539 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 516 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  35.74 
 
 		 584 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 481 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 		 536 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33 
 
 		 534 aa  236  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 503 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 516 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 		 506 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 536 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 513 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 		 507 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 601 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  37.92 
 
 		 496 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 509 aa  226  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.23 
 
 		 519 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 563 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.25 
 
 		 503 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.71 
 
 		 532 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.97 
 
 		 607 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  34.82 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 519 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  37.15 
 
 		 502 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.78 
 
 		 522 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.27 
 
 		 538 aa  217  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.59 
 
 		 626 aa  216  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>