More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0024 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  72.71 
 
 		 535 aa  695    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 541 aa  1061    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  49.23 
 
 		 517 aa  415  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  46.71 
 
 		 528 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  48.39 
 
 		 584 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  50.94 
 
 		 588 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  43.58 
 
 		 524 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  45.31 
 
 		 601 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  42.74 
 
 		 562 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  47.3 
 
 		 521 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 		 528 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  47.7 
 
 		 509 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 526 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 558 aa  360  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  47.44 
 
 		 496 aa  359  7e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  44.09 
 
 		 529 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  45.25 
 
 		 513 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 509 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 		 518 aa  356  6.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  45.06 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  44.02 
 
 		 519 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  44.31 
 
 		 514 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  46.41 
 
 		 536 aa  352  8.999999999999999e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  44.91 
 
 		 554 aa  352  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  47.55 
 
 		 563 aa  351  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  46.22 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  42.21 
 
 		 516 aa  347  3e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 532 aa  343  7e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 		 509 aa  341  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  42.05 
 
 		 553 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  45.77 
 
 		 521 aa  340  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 575 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  43.87 
 
 		 539 aa  334  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 540 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  45.49 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 509 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  45.17 
 
 		 506 aa  329  8e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 		 503 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  43.11 
 
 		 508 aa  326  6e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  43.29 
 
 		 505 aa  326  8.000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 		 524 aa  324  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  46.94 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 525 aa  319  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  43.23 
 
 		 525 aa  319  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 525 aa  319  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  45.71 
 
 		 513 aa  318  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.57 
 
 		 537 aa  311  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 		 516 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 533 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 		 508 aa  303  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 536 aa  300  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  39.88 
 
 		 490 aa  299  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 		 502 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 		 514 aa  293  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 555 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 		 528 aa  284  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  42.16 
 
 		 497 aa  284  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  41.63 
 
 		 535 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 517 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 		 516 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  36.35 
 
 		 492 aa  259  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  37.87 
 
 		 516 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 500 aa  250  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 511 aa  247  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 511 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 503 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 		 510 aa  240  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 500 aa  238  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.27 
 
 		 525 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.94 
 
 		 538 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  34.69 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.88 
 
 		 534 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 514 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 495 aa  225  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 516 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  37.57 
 
 		 528 aa  224  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 504 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  36.15 
 
 		 517 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  36.21 
 
 		 513 aa  217  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.62 
 
 		 503 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 520 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.07 
 
 		 519 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 594 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 		 522 aa  205  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 507 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.28 
 
 		 626 aa  197  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 503 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 		 524 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.18 
 
 		 532 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  33.4 
 
 		 502 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.12 
 
 		 531 aa  193  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.69 
 
 		 607 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 501 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 519 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.84 
 
 		 518 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.59 
 
 		 525 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  34.89 
 
 		 501 aa  187  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  33.9 
 
 		 501 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 		 496 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.402473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>