More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9246 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
555 aa  1078    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  48.72 
 
 
525 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  48.72 
 
 
525 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  48.72 
 
 
525 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 
528 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  47.12 
 
 
562 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  48.58 
 
 
533 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 
521 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  48.99 
 
 
517 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 
588 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  46.31 
 
 
516 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  49.68 
 
 
513 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.69 
 
 
537 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  45.6 
 
 
529 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  44.65 
 
 
532 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 
509 aa  363  6e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  48.63 
 
 
521 aa  362  8e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  47.6 
 
 
535 aa  362  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  42.94 
 
 
519 aa  362  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  45.95 
 
 
501 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  42.83 
 
 
524 aa  356  7.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  44.53 
 
 
526 aa  355  8.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  41.93 
 
 
518 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  44.23 
 
 
528 aa  350  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  46.25 
 
 
508 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  46.71 
 
 
554 aa  347  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  44.14 
 
 
509 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  45.33 
 
 
575 aa  341  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  46.42 
 
 
524 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 
517 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  44.54 
 
 
516 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  44.8 
 
 
558 aa  326  8.000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  44.86 
 
 
505 aa  323  4e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  45.44 
 
 
509 aa  323  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  43.64 
 
 
601 aa  323  6e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  42.27 
 
 
539 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  42.16 
 
 
509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  41.38 
 
 
511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  41.94 
 
 
584 aa  320  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  43.29 
 
 
514 aa  320  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 
513 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 
553 aa  312  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  46.52 
 
 
481 aa  312  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  41.97 
 
 
540 aa  312  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 
536 aa  309  9e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  43.55 
 
 
496 aa  307  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  43.82 
 
 
563 aa  306  9.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  40.61 
 
 
508 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 
541 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 
513 aa  300  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  42.39 
 
 
536 aa  299  8e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 
516 aa  297  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 
490 aa  295  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  43.41 
 
 
528 aa  293  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  44.37 
 
 
502 aa  292  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  38.22 
 
 
535 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 
500 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  41.97 
 
 
510 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 
503 aa  282  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 
500 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.75 
 
 
525 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 
516 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  40.79 
 
 
517 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  39.92 
 
 
516 aa  279  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 
520 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
506 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 
497 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  39.45 
 
 
514 aa  276  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.26 
 
 
534 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  38.09 
 
 
500 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  39.21 
 
 
495 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 
514 aa  270  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 
503 aa  269  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  39.17 
 
 
492 aa  268  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  37.12 
 
 
504 aa  267  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.24 
 
 
538 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 
607 aa  266  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  36.3 
 
 
519 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.33 
 
 
522 aa  263  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  37.14 
 
 
513 aa  262  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  36.93 
 
 
503 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.52 
 
 
532 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  35.12 
 
 
495 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  34.92 
 
 
495 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  34.92 
 
 
495 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  34.92 
 
 
495 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  34.92 
 
 
495 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  40.12 
 
 
528 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  34.75 
 
 
494 aa  249  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.08 
 
 
626 aa  249  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.04 
 
 
519 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  39.08 
 
 
507 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  39.52 
 
 
501 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  38.92 
 
 
501 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  37.02 
 
 
509 aa  242  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  39.87 
 
 
511 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  37.32 
 
 
502 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  37.8 
 
 
594 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  37.1 
 
 
501 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>