More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3005 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



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Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
512 aa  1002    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  82.93 
 
 
509 aa  791    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.02 
 
 
493 aa  597  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  59.62 
 
 
505 aa  568  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.04 
 
 
511 aa  568  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.19 
 
 
646 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.19 
 
 
646 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.03 
 
 
646 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.44 
 
 
609 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.44 
 
 
627 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  58.12 
 
 
521 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  52.92 
 
 
579 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.1 
 
 
494 aa  468  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.84 
 
 
546 aa  434  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.01 
 
 
534 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.06 
 
 
504 aa  428  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.04 
 
 
540 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  43.58 
 
 
790 aa  304  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.53 
 
 
579 aa  286  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.51 
 
 
528 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.68 
 
 
478 aa  243  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.47 
 
 
529 aa  243  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.91 
 
 
522 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.68 
 
 
579 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.32 
 
 
545 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.02 
 
 
534 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.34 
 
 
514 aa  230  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.16 
 
 
488 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.01 
 
 
489 aa  223  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  32.24 
 
 
467 aa  223  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.84 
 
 
626 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.82 
 
 
504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.8 
 
 
522 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.3 
 
 
510 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.93 
 
 
469 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.48 
 
 
496 aa  216  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.95 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  33.47 
 
 
530 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 
520 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.92 
 
 
474 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.28 
 
 
489 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.27 
 
 
524 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.29 
 
 
498 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.2 
 
 
469 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.19 
 
 
564 aa  210  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.6 
 
 
532 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.41 
 
 
503 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.68 
 
 
522 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 
508 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32 
 
 
534 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.92 
 
 
763 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.03 
 
 
520 aa  206  7e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 
521 aa  206  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.86 
 
 
527 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.48 
 
 
471 aa  204  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.85 
 
 
521 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 
478 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 
478 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
520 aa  203  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 
520 aa  203  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 
524 aa  202  8e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 
520 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 
520 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.48 
 
 
511 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 
532 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.08 
 
 
520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.94 
 
 
520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.01 
 
 
478 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.01 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.08 
 
 
520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.11 
 
 
525 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  32.05 
 
 
480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.26 
 
 
558 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 
520 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  33.8 
 
 
457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  33.8 
 
 
457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 
457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.35 
 
 
502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 
520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 
520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  33.8 
 
 
457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
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NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  33.8 
 
 
457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.84 
 
 
520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  33.8 
 
 
457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_01799  predicted transporter  33.57 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.1 
 
 
530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.47 
 
 
621 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  33.57 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 
500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
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NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.09 
 
 
529 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.4 
 
 
487 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
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NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 
532 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.42 
 
 
452 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  30.78 
 
 
503 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
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NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 
635 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  33.49 
 
 
457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 
537 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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