More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7777 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7777  transporter  100 
 
 		 480 aa  931    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  63.52 
 
 		 493 aa  559  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  59.36 
 
 		 484 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  59.31 
 
 		 481 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  54.04 
 
 		 630 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  53.98 
 
 		 487 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  53.64 
 
 		 491 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.22 
 
 		 502 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  41.24 
 
 		 518 aa  360  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  42.49 
 
 		 483 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.91 
 
 		 583 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  39.58 
 
 		 492 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.65 
 
 		 564 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 480 aa  283  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 485 aa  273  7e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  43.69 
 
 		 503 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 492 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 477 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1069  major facilitator superfamily MFS_1  40.09 
 
 		 476 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 		 484 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 555 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 494 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 486 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 		 528 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 		 488 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  37.58 
 
 		 480 aa  246  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 		 471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  35.65 
 
 		 488 aa  243  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 486 aa  242  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 486 aa  242  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 514 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 514 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  37.03 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 486 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 487 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 486 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 480 aa  230  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 484 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 		 509 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 480 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 513 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 493 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 493 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 471 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 		 627 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 		 505 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.42 
 
 		 541 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1209  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 486 aa  209  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 484 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 524 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  35.81 
 
 		 489 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.67 
 
 		 527 aa  207  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 		 609 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.89 
 
 		 509 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 		 493 aa  206  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 504 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 486 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 488 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.91 
 
 		 551 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 		 512 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  31.75 
 
 		 579 aa  199  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 		 646 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 		 646 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.1 
 
 		 579 aa  199  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.6 
 
 		 646 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 		 487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 		 490 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.35 
 
 		 504 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 512 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 505 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 467 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 480 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.42 
 
 		 500 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 473 aa  193  7e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 		 540 aa  192  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.96 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.58 
 
 		 505 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.74 
 
 		 478 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.74 
 
 		 484 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 		 528 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 516 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.61 
 
 		 534 aa  187  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.52 
 
 		 532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.82 
 
 		 511 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.46 
 
 		 478 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  32.11 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.45 
 
 		 489 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.43 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.15 
 
 		 522 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 475 aa  180  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>