More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2644 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 484 aa  969    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 471 aa  286  7e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.19 
 
 		 583 aa  236  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  36.18 
 
 		 493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 484 aa  234  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.26 
 
 		 481 aa  230  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 471 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 555 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 486 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 528 aa  225  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 509 aa  223  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 488 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.55 
 
 		 516 aa  220  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  37.21 
 
 		 488 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 486 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 630 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 471 aa  216  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  36.4 
 
 		 471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  30.95 
 
 		 480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 486 aa  213  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 		 488 aa  213  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 493 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 493 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 480 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 		 564 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 488 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  32.04 
 
 		 484 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 480 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 486 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 485 aa  194  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 480 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 		 459 aa  191  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 518 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.93 
 
 		 502 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 513 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 473 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  31.24 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 491 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  30.68 
 
 		 489 aa  177  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 480 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 524 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  33.1 
 
 		 503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 		 516 aa  174  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 504 aa  173  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 480 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.42 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 479 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 		 505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  28.25 
 
 		 476 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 527 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.71 
 
 		 498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.88 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 505 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 528 aa  163  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.47 
 
 		 505 aa  163  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 471 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  28.38 
 
 		 483 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.61 
 
 		 487 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21380  arabinose efflux permease family protein  27.8 
 
 		 481 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000069815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 503 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.24 
 
 		 534 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.07 
 
 		 522 aa  150  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.56 
 
 		 487 aa  150  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 		 478 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  30.39 
 
 		 480 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 		 540 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.81 
 
 		 519 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 		 509 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.23 
 
 		 478 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.23 
 
 		 484 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 		 609 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.18 
 
 		 525 aa  146  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.86 
 
 		 788 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  28.7 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2045  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 506 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.706094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1209  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>