More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6497 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 630 aa  1231    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  62.16 
 
 		 484 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  60.19 
 
 		 481 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  56.04 
 
 		 493 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  54.24 
 
 		 480 aa  491  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  51.67 
 
 		 487 aa  405  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  49.78 
 
 		 491 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.88 
 
 		 583 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.46 
 
 		 502 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  43.05 
 
 		 483 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  41.43 
 
 		 518 aa  320  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.98 
 
 		 564 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 471 aa  302  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 480 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  41.84 
 
 		 503 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 492 aa  264  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  37.61 
 
 		 477 aa  262  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1069  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 		 476 aa  256  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 528 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 		 484 aa  253  9.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 492 aa  249  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 486 aa  247  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  37.84 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 513 aa  241  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 494 aa  240  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 480 aa  240  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 514 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 514 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 486 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 487 aa  230  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 		 488 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 486 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  35.92 
 
 		 488 aa  229  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 486 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 509 aa  228  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 471 aa  223  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 		 488 aa  221  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 524 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 484 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 473 aa  217  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 493 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 493 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 493 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 488 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 480 aa  210  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 516 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 471 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 470 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 484 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 		 467 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 473 aa  201  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 504 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 480 aa  196  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 512 aa  196  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 479 aa  196  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.07 
 
 		 528 aa  193  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  34.86 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 480 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2045  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 506 aa  187  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.706094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 477 aa  187  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.72 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 459 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.56 
 
 		 534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  36.52 
 
 		 505 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1209  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 486 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.1 
 
 		 500 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  32.89 
 
 		 467 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 480 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 471 aa  180  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.3 
 
 		 478 aa  180  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.9 
 
 		 487 aa  179  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.54 
 
 		 510 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.01 
 
 		 534 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  34.22 
 
 		 530 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 486 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 498 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 		 541 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.91 
 
 		 514 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.85 
 
 		 489 aa  173  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.13 
 
 		 531 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.12 
 
 		 522 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.92 
 
 		 478 aa  172  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.64 
 
 		 524 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 		 527 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 551 aa  171  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.6 
 
 		 539 aa  170  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.76 
 
 		 488 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.18 
 
 		 522 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.55 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 471 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.2 
 
 		 469 aa  168  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 479 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.04 
 
 		 500 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>