More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0738 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
488 aa  928    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  63.72 
 
 
459 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  50.11 
 
 
484 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  49.34 
 
 
493 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  49.34 
 
 
493 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  49.34 
 
 
493 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  46.99 
 
 
480 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  42.26 
 
 
528 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  42.42 
 
 
516 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  45.95 
 
 
514 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  45.95 
 
 
514 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  45.95 
 
 
486 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  46.12 
 
 
486 aa  306  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  46.97 
 
 
486 aa  302  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  46.89 
 
 
486 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  44.69 
 
 
487 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
484 aa  273  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.68 
 
 
481 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  40.32 
 
 
484 aa  266  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  42.32 
 
 
509 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 
471 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 
488 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 
488 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  39.72 
 
 
555 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 
480 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  40.38 
 
 
494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  40.66 
 
 
471 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  38.39 
 
 
493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  35.65 
 
 
480 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 
492 aa  253  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.85 
 
 
583 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  41.9 
 
 
473 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  38.04 
 
 
471 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  38.08 
 
 
470 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 
488 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 
492 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 
630 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
502 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  37.79 
 
 
480 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  36.69 
 
 
486 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.16 
 
 
564 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 
484 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
467 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  37.71 
 
 
480 aa  211  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  39.23 
 
 
486 aa  210  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  38.97 
 
 
503 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 
477 aa  203  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 
473 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 
513 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 
485 aa  197  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  35.86 
 
 
489 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  34.76 
 
 
483 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 
516 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
524 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  36.75 
 
 
505 aa  191  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 
480 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 
503 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 
487 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  37.78 
 
 
512 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 
491 aa  186  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  38.48 
 
 
480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  35.93 
 
 
480 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  39.81 
 
 
480 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  33.18 
 
 
475 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 
504 aa  176  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.63 
 
 
527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 
477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1069  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.17 
 
 
522 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  27.69 
 
 
471 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1209  major facilitator transporter  35.71 
 
 
486 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 
505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.96 
 
 
500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  36.36 
 
 
492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  35.77 
 
 
454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
518 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.88 
 
 
498 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  34.67 
 
 
498 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3066  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 
473 aa  160  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 
480 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.21 
 
 
551 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  31.03 
 
 
479 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3947  transporter  38.3 
 
 
478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000887257  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.25 
 
 
478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  31 
 
 
476 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  34.37 
 
 
473 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.87 
 
 
522 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.69 
 
 
627 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
490 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 
471 aa  152  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.79 
 
 
487 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31 
 
 
532 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.16 
 
 
527 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.42 
 
 
763 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.45 
 
 
579 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 
522 aa  151  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  35.03 
 
 
481 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  33.57 
 
 
463 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 
463 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1732  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 
478 aa  149  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>