More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0918 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  100 
 
 
486 aa  930    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  88.2 
 
 
487 aa  726    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  91.1 
 
 
514 aa  788    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  91.55 
 
 
486 aa  788    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  91.1 
 
 
514 aa  788    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  91.13 
 
 
486 aa  785    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  91.1 
 
 
486 aa  788    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  54.66 
 
 
528 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  56.4 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  45.94 
 
 
488 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  42.65 
 
 
493 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  42.23 
 
 
493 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  42.23 
 
 
493 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  46.59 
 
 
459 aa  289  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  39.64 
 
 
471 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  41.21 
 
 
484 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 
509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 
484 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  43.63 
 
 
488 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  38.83 
 
 
493 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.35 
 
 
502 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 
583 aa  266  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  36.7 
 
 
484 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.41 
 
 
481 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  36.31 
 
 
480 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  40.64 
 
 
555 aa  263  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  38.46 
 
 
480 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 
492 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 
488 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 
480 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 
630 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  41.43 
 
 
492 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.71 
 
 
564 aa  243  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  37.45 
 
 
486 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  38.03 
 
 
494 aa  240  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  39.81 
 
 
473 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 
484 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  40.57 
 
 
480 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 
471 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 
477 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 
480 aa  222  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  39.22 
 
 
503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  40.18 
 
 
480 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 
513 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 
488 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 
516 aa  217  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 
467 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  39.5 
 
 
480 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 
518 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  36.45 
 
 
505 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 
505 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  34.86 
 
 
475 aa  207  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 
524 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  36.51 
 
 
471 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  38.32 
 
 
512 aa  206  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  36.6 
 
 
470 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  36.5 
 
 
486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 
477 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 
480 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 
503 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.66 
 
 
478 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  35.58 
 
 
489 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 
487 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.18 
 
 
528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  33.26 
 
 
479 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1209  major facilitator transporter  34.25 
 
 
486 aa  190  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  30.29 
 
 
471 aa  189  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 
473 aa  189  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.55 
 
 
486 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.55 
 
 
486 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.55 
 
 
486 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.02 
 
 
508 aa  187  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 
486 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 
486 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 
486 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 
491 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 
478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  34.22 
 
 
480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.66 
 
 
532 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 
478 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.04 
 
 
502 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.76 
 
 
487 aa  179  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 
478 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 
484 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3947  transporter  36.39 
 
 
478 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000887257  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.27 
 
 
480 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 
490 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  34.37 
 
 
492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 
504 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  32.89 
 
 
483 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 
489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  31.15 
 
 
470 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.68 
 
 
474 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.89 
 
 
478 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  33.33 
 
 
489 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.87 
 
 
522 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  32.01 
 
 
476 aa  170  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.5 
 
 
524 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>