More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7521 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
492 aa  954    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  52.84 
 
 
555 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  46.46 
 
 
480 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 
528 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.85 
 
 
583 aa  290  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 
480 aa  289  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  39.37 
 
 
480 aa  290  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.58 
 
 
481 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  41.36 
 
 
493 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  38.88 
 
 
484 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  41.51 
 
 
473 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  41.55 
 
 
494 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  38.05 
 
 
484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  40.18 
 
 
488 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  36.83 
 
 
516 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  38.01 
 
 
471 aa  278  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  39.82 
 
 
492 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  38.38 
 
 
486 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  41.74 
 
 
488 aa  266  8e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  39.58 
 
 
493 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  39.35 
 
 
493 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  39.35 
 
 
493 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 
505 aa  263  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  42.9 
 
 
484 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 
471 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 
630 aa  259  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 
491 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 
467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 
485 aa  254  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 
513 aa  253  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 
484 aa  253  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  38.41 
 
 
486 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  37.81 
 
 
487 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.86 
 
 
564 aa  251  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  36.88 
 
 
470 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 
516 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  38.99 
 
 
488 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  38.73 
 
 
488 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 
509 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  37.25 
 
 
486 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  37.14 
 
 
486 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 
477 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  36.93 
 
 
471 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  37.25 
 
 
486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  38.61 
 
 
503 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  37.73 
 
 
505 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  36.57 
 
 
486 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  36.57 
 
 
514 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  36.57 
 
 
514 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.48 
 
 
502 aa  233  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  32.53 
 
 
471 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 
480 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  35.12 
 
 
480 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  31.43 
 
 
483 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 
524 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  35.33 
 
 
489 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  38.79 
 
 
480 aa  216  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 
504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  36.42 
 
 
512 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 
503 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 
490 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  32.69 
 
 
479 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 
477 aa  207  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.5 
 
 
527 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  35.63 
 
 
480 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 
473 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  37.36 
 
 
480 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3947  transporter  40.69 
 
 
478 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000887257  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 
518 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  33.48 
 
 
475 aa  199  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.98 
 
 
478 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.62 
 
 
498 aa  197  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.21 
 
 
493 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.62 
 
 
504 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
471 aa  196  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.58 
 
 
505 aa  193  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  32.19 
 
 
476 aa  193  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  31.47 
 
 
479 aa  192  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  36.95 
 
 
480 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  32.28 
 
 
481 aa  190  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.1 
 
 
522 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.87 
 
 
534 aa  186  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 
509 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  33.49 
 
 
481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.64 
 
 
512 aa  183  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.23 
 
 
487 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 
609 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  34.52 
 
 
470 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.7 
 
 
458 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.05 
 
 
476 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.64 
 
 
540 aa  177  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.85 
 
 
478 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1732  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660323  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 
494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  32.84 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  32.44 
 
 
481 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.08 
 
 
487 aa  173  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>