More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3894 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
490 aa  936    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  62.26 
 
 
481 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  61.61 
 
 
481 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  56.54 
 
 
524 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  46.57 
 
 
479 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  52.45 
 
 
480 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  46.23 
 
 
479 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  52.42 
 
 
489 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.59 
 
 
527 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  53.71 
 
 
473 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.01 
 
 
500 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2921  major facilitator transporter  44.54 
 
 
485 aa  359  8e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797495  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  54.93 
 
 
471 aa  352  7e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  48.37 
 
 
504 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  52.25 
 
 
477 aa  345  8.999999999999999e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  47.74 
 
 
481 aa  335  1e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  42.16 
 
 
476 aa  333  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4533  major facilitator transporter  41.23 
 
 
481 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 
485 aa  317  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  45.02 
 
 
480 aa  316  6e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2716  major facilitator transporter  44.99 
 
 
505 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4112  major facilitator transporter  40.83 
 
 
493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965802  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 
477 aa  303  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21380  arabinose efflux permease family protein  42.11 
 
 
481 aa  298  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000069815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2348  major facilitator transporter  43.23 
 
 
488 aa  292  9e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.65 
 
 
583 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  39.65 
 
 
555 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2231  major facilitator transporter  41.65 
 
 
470 aa  266  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.09 
 
 
564 aa  254  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 
480 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 
492 aa  246  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 
518 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
488 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
478 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  34.65 
 
 
484 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  35.15 
 
 
480 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 
484 aa  234  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.61 
 
 
502 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 
492 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.67 
 
 
481 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  36.4 
 
 
493 aa  230  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 
528 aa  229  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.61 
 
 
487 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  38 
 
 
471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 
509 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 
471 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  37.83 
 
 
486 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  35.19 
 
 
516 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  35.48 
 
 
494 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 
488 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.49 
 
 
502 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  34.86 
 
 
483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04730  arabinose efflux permease family protein  39.58 
 
 
529 aa  215  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 
630 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.95 
 
 
522 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 
487 aa  210  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 
478 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.88 
 
 
478 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 
505 aa  207  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  36.21 
 
 
486 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  36.21 
 
 
514 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  36.21 
 
 
514 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.78 
 
 
486 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.78 
 
 
486 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.78 
 
 
486 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  30.63 
 
 
471 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.78 
 
 
486 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.78 
 
 
486 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.78 
 
 
486 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  35.89 
 
 
488 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 
480 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.44 
 
 
458 aa  201  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.87 
 
 
534 aa  199  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 
480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  34.22 
 
 
471 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  40.8 
 
 
503 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  33.97 
 
 
486 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.45 
 
 
477 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  35.01 
 
 
473 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  34.72 
 
 
470 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  34.12 
 
 
497 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 
516 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.03 
 
 
508 aa  193  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  36.54 
 
 
486 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.95 
 
 
540 aa  192  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.75 
 
 
511 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.01 
 
 
528 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 
646 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 
646 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 
646 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.05 
 
 
466 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  33.6 
 
 
493 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  35.58 
 
 
486 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 
509 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
513 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.48 
 
 
488 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  33.76 
 
 
493 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>