More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1270 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  79.63 
 
 
484 aa  695    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  100 
 
 
494 aa  954    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  57.74 
 
 
488 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  57.21 
 
 
486 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  55.53 
 
 
473 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  44.52 
 
 
480 aa  332  8e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 
509 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 
488 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 
492 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 
492 aa  299  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  41.59 
 
 
555 aa  294  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  39.53 
 
 
484 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 
528 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  41.25 
 
 
481 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.69 
 
 
583 aa  279  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  42.7 
 
 
486 aa  279  9e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  38.31 
 
 
480 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  39.03 
 
 
516 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  39.42 
 
 
493 aa  276  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 
513 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  39.38 
 
 
486 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  39.38 
 
 
486 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  43.22 
 
 
505 aa  260  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  41.04 
 
 
488 aa  259  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  40.05 
 
 
493 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  38.5 
 
 
487 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.86 
 
 
502 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  38.72 
 
 
486 aa  257  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  40.05 
 
 
493 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  40.05 
 
 
493 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  38.27 
 
 
471 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 
471 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 
630 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  37.53 
 
 
514 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  37.55 
 
 
486 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  37.53 
 
 
514 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 
480 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 
524 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  39.17 
 
 
459 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  38.6 
 
 
484 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  40.42 
 
 
488 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  41.58 
 
 
503 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  37.41 
 
 
480 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 
485 aa  232  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.44 
 
 
564 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  37.06 
 
 
480 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 
491 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  36.81 
 
 
505 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
518 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  35.51 
 
 
483 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 
477 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  36.22 
 
 
470 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 
467 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 
480 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 
487 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  36.71 
 
 
471 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 
484 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 
503 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  36.18 
 
 
475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  35.96 
 
 
489 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  33.19 
 
 
479 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  33.41 
 
 
471 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  36.93 
 
 
481 aa  211  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 
471 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 
480 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  35.24 
 
 
480 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 
527 aa  203  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  37.35 
 
 
480 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  38.17 
 
 
512 aa  199  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 
516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 
490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  35.45 
 
 
481 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 
504 aa  196  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  37.35 
 
 
480 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1069  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 
476 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2045  major facilitator transporter  33.03 
 
 
506 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.706094  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.84 
 
 
522 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  33.1 
 
 
476 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3947  transporter  39.14 
 
 
478 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000887257  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.13 
 
 
500 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 
473 aa  192  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  32.78 
 
 
479 aa  192  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  34.61 
 
 
481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1209  major facilitator transporter  37.35 
 
 
486 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 
477 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.28 
 
 
522 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.69 
 
 
498 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.24 
 
 
516 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.36 
 
 
540 aa  182  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.27 
 
 
487 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21380  arabinose efflux permease family protein  35.17 
 
 
481 aa  180  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000069815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.99 
 
 
458 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3066  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 
473 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.62 
 
 
478 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.61 
 
 
532 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.62 
 
 
478 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 
486 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 
486 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 
486 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 
486 aa  177  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>