More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4340 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  100 
 
 		 480 aa  912    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  58.47 
 
 		 477 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  50.96 
 
 		 489 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  54.48 
 
 		 504 aa  349  6e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  45.26 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  42.27 
 
 		 524 aa  323  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 479 aa  322  9.000000000000001e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  41.52 
 
 		 476 aa  310  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.48 
 
 		 500 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 481 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 479 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.8 
 
 		 527 aa  286  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21380  arabinose efflux permease family protein  41.77 
 
 		 481 aa  286  8e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000069815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  46.74 
 
 		 481 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  46.22 
 
 		 490 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  43.11 
 
 		 481 aa  270  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 		 471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 485 aa  244  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  38.58 
 
 		 480 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2921  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.27 
 
 		 583 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 480 aa  222  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.62 
 
 		 481 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 518 aa  219  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  36.28 
 
 		 493 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  36.53 
 
 		 483 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 555 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  34.23 
 
 		 484 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 		 492 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 488 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 486 aa  207  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 492 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4533  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 481 aa  203  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.85 
 
 		 763 aa  202  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 494 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4112  major facilitator transporter  33.47 
 
 		 493 aa  199  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.68 
 
 		 528 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 630 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2716  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 505 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.05 
 
 		 540 aa  195  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 471 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 471 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.67 
 
 		 502 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 484 aa  193  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 473 aa  193  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  37.62 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 491 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 		 487 aa  191  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 		 512 aa  190  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.56 
 
 		 514 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.77 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2348  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 488 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.43 
 
 		 564 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04730  arabinose efflux permease family protein  38.83 
 
 		 529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4881  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 528 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  31.79 
 
 		 516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 514 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 514 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.44 
 
 		 505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2231  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 470 aa  183  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1069  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 476 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.78 
 
 		 499 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.01 
 
 		 609 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.6 
 
 		 487 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 471 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  35.93 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.09 
 
 		 458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 493 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 493 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 		 534 aa  180  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.04 
 
 		 486 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.04 
 
 		 486 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.04 
 
 		 486 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.04 
 
 		 486 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.04 
 
 		 486 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.04 
 
 		 486 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.15 
 
 		 509 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.09 
 
 		 511 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.36 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.95 
 
 		 478 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.14 
 
 		 478 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.14 
 
 		 484 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.03 
 
 		 504 aa  176  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 		 529 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.55 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2045  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.706094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 		 480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.03 
 
 		 515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  34.03 
 
 		 497 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.96 
 
 		 627 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>