More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3574 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  88.27 
 
 		 486 aa  760    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  91.1 
 
 		 486 aa  774    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  100 
 
 		 514 aa  998    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  88.68 
 
 		 486 aa  767    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  100 
 
 		 514 aa  998    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  100 
 
 		 486 aa  936    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  85.39 
 
 		 487 aa  703    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  52.83 
 
 		 528 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  53.91 
 
 		 516 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  46.12 
 
 		 488 aa  309  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 493 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 493 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 493 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  47.6 
 
 		 459 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  41.43 
 
 		 484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 471 aa  278  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 		 509 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  38.59 
 
 		 484 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.28 
 
 		 502 aa  266  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  37.93 
 
 		 493 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 555 aa  263  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  36.34 
 
 		 484 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.18 
 
 		 481 aa  259  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 		 492 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 480 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.54 
 
 		 583 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  35.92 
 
 		 480 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 		 488 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 		 492 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 480 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 630 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 486 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.17 
 
 		 564 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 484 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 494 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 473 aa  231  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 471 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  40.18 
 
 		 480 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  40.67 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 513 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  39.96 
 
 		 480 aa  220  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 480 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 		 480 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 		 477 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 		 488 aa  210  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 505 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 471 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 		 516 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 480 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 		 485 aa  206  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 470 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  40.23 
 
 		 505 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 486 aa  203  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 512 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 524 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 480 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  35.53 
 
 		 489 aa  195  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 503 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 471 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 477 aa  194  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1209  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 486 aa  193  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 479 aa  190  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.26 
 
 		 508 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.29 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 		 486 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 		 486 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 		 486 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.87 
 
 		 487 aa  183  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.38 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.38 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.38 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 487 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  33.04 
 
 		 483 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.37 
 
 		 532 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 471 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.48 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.86 
 
 		 478 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.07 
 
 		 528 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.99 
 
 		 480 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  32.18 
 
 		 476 aa  176  9e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.82 
 
 		 524 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.3 
 
 		 508 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.95 
 
 		 474 aa  173  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  34.22 
 
 		 489 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.66 
 
 		 510 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.25 
 
 		 525 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.19 
 
 		 534 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>