More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1430 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  100 
 
 		 480 aa  933    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  63.03 
 
 		 480 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  62.71 
 
 		 480 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  53.44 
 
 		 473 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  52.6 
 
 		 475 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1732  major facilitator superfamily MFS_1  53.81 
 
 		 478 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 494 aa  227  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 		 488 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 		 492 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 486 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 480 aa  223  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 528 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 473 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  37.92 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  37.92 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 486 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  37.92 
 
 		 486 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 492 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 486 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 484 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  37.71 
 
 		 488 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 484 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.47 
 
 		 583 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 555 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  37.55 
 
 		 487 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  34.55 
 
 		 480 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  36.11 
 
 		 516 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 513 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 		 503 aa  202  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  34.61 
 
 		 483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  33.77 
 
 		 493 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.56 
 
 		 502 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 480 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 493 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 493 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 505 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.04 
 
 		 481 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 488 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 493 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  34.2 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 459 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 471 aa  193  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 512 aa  192  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  35.89 
 
 		 467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 470 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 516 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 488 aa  187  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 524 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 505 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 471 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.6 
 
 		 564 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  33.81 
 
 		 503 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 630 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3066  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 		 478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 		 484 aa  173  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 		 478 aa  172  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.18 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.18 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.3 
 
 		 478 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 485 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1069  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  29.93 
 
 		 498 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 528 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 491 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.08 
 
 		 527 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.09 
 
 		 500 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  31.57 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 481 aa  156  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 477 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 482 aa  156  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.08 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.08 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.08 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3947  transporter  40.19 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000887257  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 		 474 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.83 
 
 		 486 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.83 
 
 		 486 aa  154  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.83 
 
 		 486 aa  154  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.59 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1209  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 486 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  29.93 
 
 		 470 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.3 
 
 		 498 aa  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2045  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 506 aa  150  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.706094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.17 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>