More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1732 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1732  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
478 aa  915    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660323  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  78.12 
 
 
473 aa  616  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  58.35 
 
 
480 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  53.85 
 
 
480 aa  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  58.05 
 
 
480 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  54.68 
 
 
475 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 
492 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 
503 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 
488 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 
480 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  40.12 
 
 
486 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  36.09 
 
 
486 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 
484 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  36.91 
 
 
486 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 
509 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  37.99 
 
 
488 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  36.91 
 
 
486 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  36.71 
 
 
494 aa  201  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  38.13 
 
 
487 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  36.48 
 
 
514 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  36.48 
 
 
514 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  36.48 
 
 
486 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  37.1 
 
 
493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  37.1 
 
 
493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  37.1 
 
 
493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 
492 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  40.52 
 
 
484 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 
471 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  34.34 
 
 
512 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
488 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.95 
 
 
583 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  34.8 
 
 
555 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 
505 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 
516 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  33.1 
 
 
493 aa  186  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 
459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  35.63 
 
 
473 aa  182  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  32.44 
 
 
484 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  30.71 
 
 
480 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
528 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 
477 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  35.56 
 
 
480 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 
478 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.18 
 
 
478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  31.46 
 
 
471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 
484 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  33.49 
 
 
470 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  32.65 
 
 
498 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 
484 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.07 
 
 
481 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  34.47 
 
 
471 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  31.51 
 
 
516 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 
478 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 
564 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  33.41 
 
 
471 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  34.23 
 
 
505 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3066  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 
473 aa  169  9e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 
467 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
524 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  30.19 
 
 
483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  32.64 
 
 
458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 
630 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  33.25 
 
 
486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
486 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  33.11 
 
 
480 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
486 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
486 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
486 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
486 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
486 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  32.41 
 
 
481 aa  159  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
480 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 
512 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  32.95 
 
 
503 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  33.88 
 
 
489 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  30 
 
 
479 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.91 
 
 
502 aa  156  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.18 
 
 
613 aa  156  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 
485 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.64 
 
 
504 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 
480 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 
502 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
494 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3947  transporter  38.99 
 
 
478 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000887257  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.22 
 
 
522 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2073  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  32.61 
 
 
561 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132683  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.87 
 
 
478 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 
452 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  28.85 
 
 
476 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.59 
 
 
500 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  34.29 
 
 
455 aa  150  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 
527 aa  149  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.74 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  32.53 
 
 
468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  32.53 
 
 
468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  32.2 
 
 
511 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>