More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2727 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 480 aa  904    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  41.07 
 
 		 481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  42.07 
 
 		 493 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.61 
 
 		 502 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  38.46 
 
 		 480 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  39.05 
 
 		 484 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 630 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  36.61 
 
 		 483 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 		 487 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 494 aa  229  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  36.7 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 471 aa  226  9e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 		 491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 486 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 		 480 aa  219  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1069  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 476 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 484 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 583 aa  213  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 555 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 564 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  36.27 
 
 		 503 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 524 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 488 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 		 492 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 490 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 485 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  36.67 
 
 		 481 aa  195  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 480 aa  194  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  37.79 
 
 		 504 aa  193  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 467 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 481 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 480 aa  186  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 493 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 471 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  30.51 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.21 
 
 		 522 aa  180  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 513 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 484 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 471 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 479 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.13 
 
 		 516 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.7 
 
 		 527 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 486 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  34.2 
 
 		 488 aa  176  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 514 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 514 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  34.49 
 
 		 459 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 481 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  34.39 
 
 		 489 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 486 aa  173  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 		 528 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 509 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.28 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 486 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 492 aa  170  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 477 aa  170  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 486 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 516 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.9 
 
 		 757 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 487 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 488 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 473 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.81 
 
 		 502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1209  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.4 
 
 		 508 aa  164  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2045  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 506 aa  163  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.706094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2921  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.68 
 
 		 478 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.68 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.68 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21380  arabinose efflux permease family protein  35.01 
 
 		 481 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000069815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.96 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 457 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 		 480 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2348  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 488 aa  157  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.65 
 
 		 487 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.39 
 
 		 551 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.27 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  34.11 
 
 		 497 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 505 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.82 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  34.95 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 471 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>