More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2542 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  100 
 
 		 481 aa  916    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  86.88 
 
 		 481 aa  717    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  62.53 
 
 		 490 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  53.18 
 
 		 524 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  47.25 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  49.14 
 
 		 479 aa  395  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  50.43 
 
 		 480 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2921  major facilitator transporter  44.4 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.56 
 
 		 527 aa  336  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  43.21 
 
 		 476 aa  336  5e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  50.23 
 
 		 471 aa  334  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.21 
 
 		 500 aa  334  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  49.66 
 
 		 489 aa  326  7e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  50.9 
 
 		 504 aa  322  9.000000000000001e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4533  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 481 aa  316  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  52.05 
 
 		 477 aa  316  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4112  major facilitator transporter  40.66 
 
 		 493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  47.28 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2716  major facilitator transporter  43.11 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  42.98 
 
 		 481 aa  306  4.0000000000000004e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  46.84 
 
 		 480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21380  arabinose efflux permease family protein  43.01 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000069815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2348  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 488 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2231  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 470 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 477 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  36.16 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.71 
 
 		 564 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.49 
 
 		 583 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 484 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 555 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 488 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  31.24 
 
 		 518 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.55 
 
 		 502 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 471 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  36 
 
 		 494 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.92 
 
 		 493 aa  206  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 509 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  33.78 
 
 		 493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.44 
 
 		 502 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  32.98 
 
 		 480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 505 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 		 478 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 486 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 		 480 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04730  arabinose efflux permease family protein  37.64 
 
 		 529 aa  193  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  35.83 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 528 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  35 
 
 		 486 aa  190  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.63 
 
 		 481 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.07 
 
 		 478 aa  191  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.13 
 
 		 478 aa  190  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 471 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  38.55 
 
 		 503 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 486 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 486 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 486 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 486 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 486 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 486 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.57 
 
 		 534 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 516 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  32.97 
 
 		 484 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 473 aa  184  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.59 
 
 		 522 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 505 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.28 
 
 		 540 aa  182  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.45 
 
 		 478 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.79 
 
 		 516 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 478 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 471 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3121  major facilitator transporter  51.52 
 
 		 174 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083055  hitchhiker  0.000923816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.53 
 
 		 505 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 		 483 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 498 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 512 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.52 
 
 		 487 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.3 
 
 		 541 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 470 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.17 
 
 		 579 aa  176  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 504 aa  176  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.24 
 
 		 508 aa  176  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.1 
 
 		 763 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  30.51 
 
 		 483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 487 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.45 
 
 		 494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.59 
 
 		 522 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 		 646 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 		 646 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.81 
 
 		 646 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 486 aa  174  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>