More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2348 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2348  major facilitator transporter  100 
 
 		 488 aa  923    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2231  major facilitator transporter  78.09 
 
 		 470 aa  601  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2921  major facilitator transporter  65.35 
 
 		 485 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2716  major facilitator transporter  60.08 
 
 		 505 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4533  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 481 aa  336  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 481 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4112  major facilitator transporter  43.35 
 
 		 493 aa  307  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 481 aa  286  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 479 aa  280  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  38.45 
 
 		 479 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  42.77 
 
 		 490 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 524 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  33.68 
 
 		 476 aa  227  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  39.81 
 
 		 489 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 		 480 aa  224  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 471 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 473 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 		 504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3121  major facilitator transporter  65.06 
 
 		 174 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083055  hitchhiker  0.000923816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 		 477 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 480 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.32 
 
 		 527 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 477 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  36.44 
 
 		 481 aa  199  9e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21380  arabinose efflux permease family protein  33.33 
 
 		 481 aa  193  7e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000069815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.42 
 
 		 500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.7 
 
 		 564 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.4 
 
 		 583 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  32.24 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  32.87 
 
 		 493 aa  169  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  31.73 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.6 
 
 		 481 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.18 
 
 		 502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 518 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 528 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 		 504 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 487 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  34.71 
 
 		 503 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.1 
 
 		 478 aa  150  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.95 
 
 		 487 aa  150  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.18 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  29.44 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  28.96 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.89 
 
 		 487 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.55 
 
 		 522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 555 aa  147  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 505 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  26.68 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 486 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.88 
 
 		 541 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 		 513 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.99 
 
 		 508 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 491 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 480 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.41 
 
 		 476 aa  142  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 630 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.47 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4757  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 633 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4511  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.43 
 
 		 532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0561268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.26 
 
 		 488 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.32 
 
 		 540 aa  140  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.33 
 
 		 518 aa  140  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 488 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.88 
 
 		 490 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  28.84 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.98 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 763 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.92 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  27.77 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.96 
 
 		 551 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.79 
 
 		 458 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.54 
 
 		 553 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 465 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.07 
 
 		 505 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.75 
 
 		 489 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.51 
 
 		 528 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  30.29 
 
 		 483 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.26 
 
 		 534 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.03 
 
 		 484 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>