More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1720 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  100 
 
 
473 aa  899    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  46.48 
 
 
524 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  54.07 
 
 
490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  48.64 
 
 
480 aa  336  5e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  48.8 
 
 
489 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.76 
 
 
527 aa  325  9e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  51.33 
 
 
471 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  49.02 
 
 
481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  46.84 
 
 
481 aa  319  9e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.94 
 
 
500 aa  306  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  50.49 
 
 
504 aa  299  7e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 
477 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  41.39 
 
 
479 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  47.3 
 
 
481 aa  292  8e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  41.51 
 
 
477 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  40.62 
 
 
476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  40.95 
 
 
479 aa  283  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  42.79 
 
 
480 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  42.05 
 
 
485 aa  270  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2921  major facilitator transporter  38.01 
 
 
485 aa  259  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797495  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21380  arabinose efflux permease family protein  37.39 
 
 
481 aa  253  5.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000069815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.35 
 
 
583 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.13 
 
 
564 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4533  major facilitator transporter  37.08 
 
 
481 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 
480 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 
518 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  36.64 
 
 
493 aa  229  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.33 
 
 
502 aa  226  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2348  major facilitator transporter  37.28 
 
 
488 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  37.39 
 
 
484 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 
630 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2716  major facilitator transporter  38.4 
 
 
505 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 
484 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  35.92 
 
 
471 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.2 
 
 
481 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  35.05 
 
 
480 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4112  major facilitator transporter  35.04 
 
 
493 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965802  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  35.17 
 
 
528 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  39.52 
 
 
503 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  39.71 
 
 
492 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 
488 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2231  major facilitator transporter  36.95 
 
 
470 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  35.23 
 
 
516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 
487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 
513 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 
486 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 
486 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 
486 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 
486 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 
486 aa  194  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 
486 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 
509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  36.28 
 
 
486 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 
471 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  34 
 
 
486 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.24 
 
 
502 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  35.58 
 
 
555 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33 
 
 
478 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 
488 aa  187  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  34.19 
 
 
494 aa  186  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.72 
 
 
512 aa  186  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  34.29 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.72 
 
 
458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.29 
 
 
540 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
478 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.62 
 
 
498 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.26 
 
 
469 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  34.05 
 
 
483 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.82 
 
 
508 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 
480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.82 
 
 
487 aa  181  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.34 
 
 
478 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.34 
 
 
484 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.04 
 
 
539 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.83 
 
 
522 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 
505 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  38.15 
 
 
512 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
522 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.45 
 
 
487 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  28.57 
 
 
471 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.92 
 
 
527 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  31.84 
 
 
486 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.02 
 
 
541 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  33.65 
 
 
486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.16 
 
 
493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  33.41 
 
 
487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.44 
 
 
509 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 
505 aa  173  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04730  arabinose efflux permease family protein  38.66 
 
 
529 aa  173  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4881  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1209  major facilitator transporter  38.76 
 
 
486 aa  172  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
491 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  32.27 
 
 
514 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  32.27 
 
 
514 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.54 
 
 
508 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.95 
 
 
511 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 
579 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 
484 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  32.5 
 
 
486 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>