More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2726 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 500 aa  961    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  44.81 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.21 
 
 		 527 aa  343  5e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  51.01 
 
 		 490 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  43.97 
 
 		 489 aa  326  6e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  45.53 
 
 		 481 aa  323  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  49.44 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  45.72 
 
 		 480 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  48.6 
 
 		 481 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 480 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  45.91 
 
 		 504 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 479 aa  300  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  47.44 
 
 		 471 aa  293  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 479 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  39.42 
 
 		 476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  40.89 
 
 		 481 aa  272  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2921  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  38.19 
 
 		 485 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.77 
 
 		 583 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21380  arabinose efflux permease family protein  38.05 
 
 		 481 aa  256  7e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000069815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4533  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 481 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 		 477 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4112  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 493 aa  230  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 		 480 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 518 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 		 484 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 478 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 488 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.03 
 
 		 478 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.03 
 
 		 484 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 		 492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.09 
 
 		 564 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  34.82 
 
 		 484 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 471 aa  210  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  33.63 
 
 		 480 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 555 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2716  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 505 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 486 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 486 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 486 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.24 
 
 		 481 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.4 
 
 		 502 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35 
 
 		 502 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2348  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 488 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 		 486 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 494 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 		 486 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 		 486 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.1 
 
 		 534 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  33.89 
 
 		 493 aa  203  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.67 
 
 		 498 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 		 630 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 		 522 aa  199  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.15 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.03 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.65 
 
 		 609 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04730  arabinose efflux permease family protein  38.63 
 
 		 529 aa  197  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 493 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.61 
 
 		 540 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.06 
 
 		 522 aa  195  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.44 
 
 		 627 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2231  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 470 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.21 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 509 aa  194  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 		 534 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 		 527 aa  192  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.1 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.86 
 
 		 504 aa  190  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  32.59 
 
 		 483 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.28 
 
 		 508 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 528 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.86 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.1 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.89 
 
 		 514 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 646 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 646 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  34.8 
 
 		 487 aa  187  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 646 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 		 516 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 512 aa  186  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  36.52 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.01 
 
 		 763 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 516 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.3 
 
 		 539 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  32.23 
 
 		 579 aa  183  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.19 
 
 		 534 aa  183  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 471 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.57 
 
 		 504 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.56 
 
 		 546 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 509 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.91 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.56 
 
 		 517 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 505 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.43 
 
 		 545 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.63 
 
 		 579 aa  181  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>