More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2572 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
505 aa  943    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 
492 aa  305  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  41.93 
 
 
484 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  43.46 
 
 
555 aa  293  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  43.2 
 
 
494 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  39.03 
 
 
488 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  43.63 
 
 
492 aa  285  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 
528 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  44.21 
 
 
486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 
480 aa  282  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  41.13 
 
 
516 aa  276  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 
480 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.27 
 
 
583 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  41.74 
 
 
486 aa  259  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  43.15 
 
 
505 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  40.37 
 
 
473 aa  257  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 
509 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  39.83 
 
 
485 aa  252  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  39.72 
 
 
484 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  40.65 
 
 
493 aa  249  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 
488 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 
471 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 
477 aa  246  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.66 
 
 
481 aa  244  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  41.92 
 
 
503 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 
524 aa  243  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  39.61 
 
 
486 aa  242  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  35.92 
 
 
471 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  37.67 
 
 
480 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 
516 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  40 
 
 
493 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  39.78 
 
 
514 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  39.78 
 
 
514 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  39.78 
 
 
486 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  40 
 
 
493 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  40 
 
 
493 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 
630 aa  239  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  39.03 
 
 
486 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  39.45 
 
 
486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 
564 aa  237  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  41.99 
 
 
488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 
467 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  41.82 
 
 
471 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 
513 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  41.94 
 
 
487 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.42 
 
 
502 aa  229  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  41.57 
 
 
470 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  40.58 
 
 
484 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.08 
 
 
527 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  41.34 
 
 
512 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  35.84 
 
 
483 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  37.73 
 
 
480 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 
491 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  39.57 
 
 
489 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  38.63 
 
 
481 aa  216  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.97 
 
 
478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  37.94 
 
 
481 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 
487 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  36.28 
 
 
475 aa  211  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.91 
 
 
488 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 
503 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 
471 aa  209  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  38.52 
 
 
480 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 
490 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  39.43 
 
 
480 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  32.76 
 
 
476 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  35.52 
 
 
481 aa  201  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  36.04 
 
 
488 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
518 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.16 
 
 
522 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 
477 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3947  transporter  42.93 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000887257  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.77 
 
 
500 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.96 
 
 
493 aa  193  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 
484 aa  192  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 
528 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 
504 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  33.18 
 
 
480 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.84 
 
 
763 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  38.31 
 
 
480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 
473 aa  191  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.52 
 
 
627 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.41 
 
 
458 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2045  major facilitator transporter  33.41 
 
 
506 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.706094  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  38.79 
 
 
480 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.76 
 
 
540 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.91 
 
 
609 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 
459 aa  186  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.07 
 
 
478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.22 
 
 
502 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.07 
 
 
484 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.56 
 
 
534 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.89 
 
 
487 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  39.25 
 
 
469 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  37.27 
 
 
492 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21380  arabinose efflux permease family protein  35.2 
 
 
481 aa  182  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000069815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  37.7 
 
 
473 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.53 
 
 
529 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.6 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 
512 aa  181  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>