More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5344 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  100 
 
 
503 aa  941    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.86 
 
 
583 aa  329  7e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.11 
 
 
502 aa  316  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  43.14 
 
 
481 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  42.46 
 
 
484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  44.23 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 
480 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  43.69 
 
 
480 aa  306  8.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  41.76 
 
 
630 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  44 
 
 
486 aa  293  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  41.57 
 
 
471 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 
492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.74 
 
 
564 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  43.91 
 
 
484 aa  280  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  42 
 
 
555 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 
471 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
492 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 
477 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 
524 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 
487 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  40.61 
 
 
509 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 
516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 
518 aa  253  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  41.39 
 
 
514 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  41.39 
 
 
514 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  42.24 
 
 
494 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  41.39 
 
 
486 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  37.61 
 
 
483 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  38.23 
 
 
528 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 
488 aa  250  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 
488 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  41.09 
 
 
486 aa  246  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  38.59 
 
 
480 aa  244  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 
513 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  40.86 
 
 
486 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  42.07 
 
 
488 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  40.9 
 
 
486 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 
467 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  40.19 
 
 
473 aa  237  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  38.97 
 
 
488 aa  236  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  39.9 
 
 
516 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  40.38 
 
 
487 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  42.77 
 
 
484 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 
505 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 
480 aa  231  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  39.53 
 
 
493 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.34 
 
 
527 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  38.6 
 
 
489 aa  223  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  38.76 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2045  major facilitator transporter  34.67 
 
 
506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.706094  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  40.85 
 
 
504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  39.06 
 
 
493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  39.06 
 
 
493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  37.62 
 
 
480 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  37.01 
 
 
486 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.38 
 
 
502 aa  217  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  39.21 
 
 
471 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  41.56 
 
 
512 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  39.52 
 
 
470 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 
522 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.51 
 
 
528 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 
471 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  39 
 
 
481 aa  213  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 
477 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 
480 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.68 
 
 
478 aa  211  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.12 
 
 
478 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.88 
 
 
478 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  35.68 
 
 
467 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  30.8 
 
 
471 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1069  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 
476 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.88 
 
 
484 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.59 
 
 
534 aa  206  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  39.28 
 
 
473 aa  206  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.3 
 
 
522 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  33.33 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.05 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  34.07 
 
 
479 aa  200  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.99 
 
 
508 aa  199  7e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.28 
 
 
509 aa  199  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.37 
 
 
488 aa  199  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  34.38 
 
 
479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  35.48 
 
 
530 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  37.44 
 
 
481 aa  196  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
478 aa  196  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.86 
 
 
502 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  37.83 
 
 
481 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 
540 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 
484 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.32 
 
 
480 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>