More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2166 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
485 aa  918    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 
477 aa  326  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  46.96 
 
 
524 aa  326  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  44.52 
 
 
481 aa  289  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.18 
 
 
481 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 
490 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  42.14 
 
 
480 aa  277  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  37.08 
 
 
480 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.08 
 
 
564 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 
488 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 
630 aa  266  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  38.46 
 
 
479 aa  264  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  41.34 
 
 
489 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  43.27 
 
 
471 aa  262  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  38.46 
 
 
493 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.31 
 
 
502 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  41.34 
 
 
481 aa  261  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  37.5 
 
 
476 aa  259  9e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.44 
 
 
583 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 
492 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  35.88 
 
 
484 aa  256  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  38.66 
 
 
471 aa  253  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.18 
 
 
500 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  42.05 
 
 
473 aa  249  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 
487 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.72 
 
 
527 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  37.39 
 
 
479 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  43.91 
 
 
504 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  38.71 
 
 
483 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 
518 aa  243  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  37.88 
 
 
555 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 
492 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 
484 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  39.44 
 
 
480 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 
471 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 
480 aa  239  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 
491 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  37.79 
 
 
516 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  36.67 
 
 
494 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  37.04 
 
 
481 aa  226  5.0000000000000005e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2921  major facilitator transporter  36.47 
 
 
485 aa  226  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797495  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 
528 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 
477 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 
505 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  38.67 
 
 
503 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21380  arabinose efflux permease family protein  36.01 
 
 
481 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000069815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 
488 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 
493 aa  222  9e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 
509 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  37.29 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 
516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.09 
 
 
534 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 
513 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  34.48 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 
480 aa  217  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  34.05 
 
 
493 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  34.05 
 
 
493 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.81 
 
 
540 aa  212  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  36.51 
 
 
470 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.93 
 
 
522 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  36.43 
 
 
471 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  35 
 
 
486 aa  209  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  32.99 
 
 
579 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  34.86 
 
 
484 aa  207  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1209  major facilitator transporter  39.26 
 
 
486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.61 
 
 
505 aa  201  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 
512 aa  201  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.04 
 
 
609 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  38.83 
 
 
512 aa  199  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  36.87 
 
 
486 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  36.87 
 
 
514 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  36.87 
 
 
514 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  34.6 
 
 
486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.01 
 
 
504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
488 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.02 
 
 
646 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.02 
 
 
646 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.21 
 
 
504 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  36.82 
 
 
488 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.79 
 
 
646 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.4 
 
 
546 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  34.89 
 
 
480 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.98 
 
 
509 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 
511 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
484 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  43.79 
 
 
505 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.07 
 
 
522 aa  192  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
467 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  34.82 
 
 
486 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.9 
 
 
522 aa  189  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  35.22 
 
 
530 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  35.96 
 
 
487 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  35.36 
 
 
486 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4533  major facilitator transporter  33.33 
 
 
481 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1069  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 
476 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.78 
 
 
627 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  36.07 
 
 
486 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.38 
 
 
487 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.23 
 
 
480 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.88 
 
 
452 aa  187  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>