More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6689 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  98.58 
 
 		 493 aa  920    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  100 
 
 		 493 aa  936    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  100 
 
 		 493 aa  936    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  69.9 
 
 		 484 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  49.34 
 
 		 488 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  49.67 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  42.32 
 
 		 528 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  42.41 
 
 		 516 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 487 aa  297  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 486 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  43.14 
 
 		 486 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 486 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 555 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 486 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 480 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 		 480 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 		 492 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 471 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 484 aa  257  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 488 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  39.82 
 
 		 494 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 		 488 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 		 509 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 		 480 aa  243  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  37.15 
 
 		 493 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 492 aa  240  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 470 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 471 aa  236  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  37 
 
 		 486 aa  236  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 		 488 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  36.82 
 
 		 484 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 473 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  33.98 
 
 		 480 aa  227  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 630 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.1 
 
 		 583 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.54 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 486 aa  216  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 513 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  39.28 
 
 		 505 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 		 485 aa  211  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 		 564 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.32 
 
 		 502 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 484 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 		 477 aa  206  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 516 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 505 aa  203  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 512 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  37.15 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  36.81 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  39.06 
 
 		 503 aa  193  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 503 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  30.51 
 
 		 483 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 473 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 471 aa  180  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  31.31 
 
 		 489 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 480 aa  179  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 491 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 487 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 504 aa  176  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 		 480 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 524 aa  170  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.11 
 
 		 522 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.1 
 
 		 488 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 475 aa  167  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3947  transporter  43.37 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000887257  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 		 478 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.04 
 
 		 484 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 518 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 		 500 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 478 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.41 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.52 
 
 		 522 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.72 
 
 		 522 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.03 
 
 		 527 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 490 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.8 
 
 		 478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  35.02 
 
 		 492 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.91 
 
 		 551 aa  156  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 463 aa  156  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 		 540 aa  156  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.53 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 481 aa  156  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.94 
 
 		 508 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.02 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.02 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.02 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.16 
 
 		 541 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.07 
 
 		 788 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.25 
 
 		 646 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>