More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2921 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2921  major facilitator transporter  100 
 
 		 485 aa  923    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2348  major facilitator transporter  65.35 
 
 		 488 aa  518  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2716  major facilitator transporter  65.5 
 
 		 505 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2231  major facilitator transporter  64.35 
 
 		 470 aa  485  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4533  major facilitator transporter  43.92 
 
 		 481 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 481 aa  355  8.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 481 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4112  major facilitator transporter  43.28 
 
 		 493 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 479 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  40.97 
 
 		 479 aa  310  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 		 524 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3121  major facilitator transporter  80.35 
 
 		 174 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083055  hitchhiker  0.000923816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 		 480 aa  262  8.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  40.68 
 
 		 489 aa  249  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  39.41 
 
 		 481 aa  248  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  42.56 
 
 		 504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  36.83 
 
 		 476 aa  244  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.02 
 
 		 500 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.74 
 
 		 527 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  41.61 
 
 		 471 aa  236  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 485 aa  233  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 473 aa  233  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 		 477 aa  229  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 480 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21380  arabinose efflux permease family protein  34.9 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000069815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 477 aa  210  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 528 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 		 564 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.68 
 
 		 583 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  34.88 
 
 		 493 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.68 
 
 		 481 aa  177  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  34.3 
 
 		 480 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.91 
 
 		 504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 484 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  31.94 
 
 		 516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 518 aa  173  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 488 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  31.07 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  33.62 
 
 		 484 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.16 
 
 		 502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 555 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  33.99 
 
 		 503 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  32.27 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.31 
 
 		 522 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.91 
 
 		 763 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.71 
 
 		 534 aa  157  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.05 
 
 		 540 aa  157  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 470 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.85 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 630 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  31.37 
 
 		 497 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 492 aa  154  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 490 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.34 
 
 		 512 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.44 
 
 		 579 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.84 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.44 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.36 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 		 504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.22 
 
 		 487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.86 
 
 		 493 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.31 
 
 		 505 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  28.42 
 
 		 462 aa  148  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 		 528 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  30.32 
 
 		 457 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 509 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.06 
 
 		 510 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 493 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 493 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.08 
 
 		 646 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2045  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 506 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.706094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.43 
 
 		 498 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.85 
 
 		 646 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23710  arabinose efflux permease family protein  32.83 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.277036 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.85 
 
 		 646 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 490 aa  144  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 		 531 aa  143  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>