More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2963 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  100 
 
 		 512 aa  981    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  44.98 
 
 		 505 aa  300  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  43.38 
 
 		 516 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3947  transporter  44.84 
 
 		 478 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000887257  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 492 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 555 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 488 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 		 492 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 486 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 480 aa  223  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  40.2 
 
 		 493 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  33.98 
 
 		 484 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.98 
 
 		 481 aa  220  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 470 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 484 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 493 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.82 
 
 		 564 aa  209  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.66 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  36.84 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 494 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 493 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 493 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  37 
 
 		 471 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39 
 
 		 583 aa  203  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  30.38 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 485 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 514 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 514 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 486 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 486 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  38.87 
 
 		 488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 630 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  38.99 
 
 		 467 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 486 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 487 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  33.13 
 
 		 524 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  33.96 
 
 		 483 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 480 aa  191  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  36.21 
 
 		 488 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 480 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 473 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 509 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  35.44 
 
 		 516 aa  187  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 488 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 475 aa  186  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  40.12 
 
 		 505 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  42.61 
 
 		 477 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 		 477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  36.16 
 
 		 518 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  40.12 
 
 		 504 aa  177  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  38.07 
 
 		 489 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.42 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 		 480 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  34.8 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 487 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1209  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.4 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 473 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.31 
 
 		 478 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.16 
 
 		 527 aa  160  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 479 aa  159  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.41 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  29.95 
 
 		 476 aa  159  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  32.68 
 
 		 481 aa  156  8e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  34.98 
 
 		 579 aa  156  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.16 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.95 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1069  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 		 504 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.89 
 
 		 489 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.78 
 
 		 508 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 481 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 627 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 481 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  35.5 
 
 		 480 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 479 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2045  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.706094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  34.93 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  32.98 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.02 
 
 		 488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.36 
 
 		 458 aa  148  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.31 
 
 		 502 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.81 
 
 		 522 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.27 
 
 		 609 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>