More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3421 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  96.71 
 
 		 509 aa  843    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 488 aa  939    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  44.51 
 
 		 484 aa  332  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 494 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  43.36 
 
 		 488 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 		 480 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 473 aa  286  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  37.99 
 
 		 528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  41.8 
 
 		 486 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  38.07 
 
 		 516 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 492 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 486 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  42.11 
 
 		 488 aa  273  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 555 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  37.55 
 
 		 492 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 486 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 486 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 486 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 514 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 514 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38 
 
 		 564 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.56 
 
 		 481 aa  260  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 487 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  36.49 
 
 		 484 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  37.92 
 
 		 493 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  37.92 
 
 		 493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  37.92 
 
 		 493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.53 
 
 		 583 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 486 aa  250  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  37.85 
 
 		 493 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.57 
 
 		 502 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 477 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  40.23 
 
 		 488 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  35.36 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 471 aa  239  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  39.92 
 
 		 503 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 		 505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 467 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 630 aa  233  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 484 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 471 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 513 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 		 459 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 484 aa  230  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 480 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 480 aa  223  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 516 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 		 491 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 524 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 518 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 479 aa  200  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 490 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  37.13 
 
 		 481 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 505 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 481 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 471 aa  189  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.82 
 
 		 522 aa  187  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  36.16 
 
 		 489 aa  186  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.7 
 
 		 493 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.22 
 
 		 527 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 		 505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.88 
 
 		 512 aa  183  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 512 aa  183  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.8 
 
 		 509 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 480 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  36.28 
 
 		 480 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.08 
 
 		 609 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  32.16 
 
 		 483 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  31.18 
 
 		 476 aa  180  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.19 
 
 		 540 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 519 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  32.61 
 
 		 497 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 481 aa  176  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.93 
 
 		 522 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  34.27 
 
 		 492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  32.93 
 
 		 467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  35.81 
 
 		 480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 504 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.54 
 
 		 500 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.97 
 
 		 487 aa  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.42 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.6 
 
 		 504 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.71 
 
 		 478 aa  170  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 528 aa  170  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 503 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.06 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  33.97 
 
 		 582 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 458 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>