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for query gene Acel_2081 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  100 
 
 
528 aa  1024    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.49 
 
 
516 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.11 
 
 
522 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.69 
 
 
469 aa  313  5.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  41.5 
 
 
519 aa  306  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.67 
 
 
522 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.58 
 
 
527 aa  249  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.29 
 
 
510 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.05 
 
 
488 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.42 
 
 
504 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.94 
 
 
532 aa  230  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.49 
 
 
511 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.47 
 
 
468 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.85 
 
 
478 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.14 
 
 
489 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35 
 
 
452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.29 
 
 
499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.94 
 
 
489 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.39 
 
 
502 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35 
 
 
486 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  35.99 
 
 
582 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.59 
 
 
486 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35 
 
 
486 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.59 
 
 
486 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35 
 
 
486 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.59 
 
 
486 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  36.34 
 
 
553 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.78 
 
 
498 aa  209  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  34.83 
 
 
467 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.55 
 
 
487 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  37.77 
 
 
510 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.97 
 
 
472 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1215  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.56 
 
 
477 aa  207  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.35 
 
 
478 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.35 
 
 
484 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.31 
 
 
486 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  32.37 
 
 
500 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.1 
 
 
478 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 
513 aa  204  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.6 
 
 
528 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  34.64 
 
 
497 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 
521 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.82 
 
 
587 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.69 
 
 
508 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 
494 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.62 
 
 
519 aa  200  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  35.73 
 
 
468 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  35.73 
 
 
468 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.79 
 
 
541 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.52 
 
 
520 aa  194  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.6 
 
 
478 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.63 
 
 
500 aa  193  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.4 
 
 
532 aa  193  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.11 
 
 
521 aa  193  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.54 
 
 
500 aa  192  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.44 
 
 
480 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.17 
 
 
551 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.72 
 
 
540 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.16 
 
 
621 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.6 
 
 
502 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  33.89 
 
 
509 aa  192  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 
541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.3 
 
 
504 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.76 
 
 
466 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.42 
 
 
479 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  33.07 
 
 
514 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.41 
 
 
522 aa  190  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.96 
 
 
478 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  30.72 
 
 
512 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 
579 aa  190  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  30.72 
 
 
512 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  30.72 
 
 
512 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.26 
 
 
539 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 
483 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  31.96 
 
 
521 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  35.97 
 
 
463 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.06 
 
 
520 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 
480 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.95 
 
 
508 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.42 
 
 
471 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.79 
 
 
478 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.95 
 
 
485 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.41 
 
 
505 aa  187  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.25 
 
 
478 aa  187  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  31.74 
 
 
512 aa  187  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
522 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.01 
 
 
474 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 
524 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.83 
 
 
516 aa  186  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  34.31 
 
 
537 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  30.41 
 
 
512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  32.51 
 
 
492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
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NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.82 
 
 
500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.82 
 
 
527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 
511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 
515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
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NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.19 
 
 
488 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.78 
 
 
458 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
465 aa  184  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  37.08 
 
 
523 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
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