More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0952 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  70.26 
 
 
534 aa  650    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
540 aa  1017    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  66.92 
 
 
546 aa  605  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.11 
 
 
505 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.04 
 
 
512 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.95 
 
 
509 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.12 
 
 
609 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  48.14 
 
 
579 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.05 
 
 
493 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.52 
 
 
511 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.9 
 
 
646 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.9 
 
 
646 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.9 
 
 
646 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.1 
 
 
494 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.15 
 
 
627 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.93 
 
 
521 aa  350  5e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.67 
 
 
504 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.14 
 
 
579 aa  320  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.67 
 
 
522 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 
790 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.74 
 
 
510 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.83 
 
 
528 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.33 
 
 
488 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  38.21 
 
 
467 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.64 
 
 
583 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.05 
 
 
489 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.86 
 
 
545 aa  229  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.91 
 
 
489 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.69 
 
 
469 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.48 
 
 
478 aa  226  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.5 
 
 
522 aa  226  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.52 
 
 
532 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.71 
 
 
504 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.54 
 
 
498 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.55 
 
 
520 aa  223  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.37 
 
 
487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.24 
 
 
502 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.63 
 
 
468 aa  219  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.86 
 
 
529 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.22 
 
 
478 aa  219  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.02 
 
 
493 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 
500 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  35.58 
 
 
468 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  35.58 
 
 
468 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.38 
 
 
541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.01 
 
 
490 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
514 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 
463 aa  216  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.02 
 
 
475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 
763 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.55 
 
 
534 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.6 
 
 
522 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 
474 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.48 
 
 
475 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.64 
 
 
496 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.2 
 
 
472 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.05 
 
 
502 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.88 
 
 
500 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.97 
 
 
579 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.24 
 
 
521 aa  210  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.68 
 
 
564 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.79 
 
 
626 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.92 
 
 
520 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.52 
 
 
478 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.78 
 
 
478 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.72 
 
 
530 aa  207  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.46 
 
 
486 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.86 
 
 
486 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.46 
 
 
486 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 
484 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.86 
 
 
486 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.46 
 
 
486 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.86 
 
 
486 aa  207  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 
478 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.14 
 
 
534 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.78 
 
 
477 aa  207  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 
520 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.84 
 
 
478 aa  206  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 
495 aa  205  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.55 
 
 
551 aa  205  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.3 
 
 
553 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  34.17 
 
 
530 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.21 
 
 
461 aa  204  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 
485 aa  203  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.56 
 
 
510 aa  203  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.71 
 
 
503 aa  203  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.36 
 
 
487 aa  202  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 
558 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.23 
 
 
531 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.53 
 
 
541 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.71 
 
 
477 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.42 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.56 
 
 
524 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.59 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  36.54 
 
 
397 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal 
 
 
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NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.13 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 
522 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 
483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
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NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.93 
 
 
532 aa  201  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
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