More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4112 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4533  major facilitator transporter  88.89 
 
 		 481 aa  817    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4112  major facilitator transporter  100 
 
 		 493 aa  941    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2921  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 485 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2348  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 488 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 481 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2231  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 470 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  37.45 
 
 		 479 aa  267  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 479 aa  262  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2716  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 505 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 		 490 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 524 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  38.19 
 
 		 489 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 480 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 		 504 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 		 500 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  32.63 
 
 		 481 aa  194  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  31.45 
 
 		 476 aa  192  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 		 477 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.35 
 
 		 527 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 		 477 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 473 aa  187  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 480 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21380  arabinose efflux permease family protein  30.99 
 
 		 481 aa  175  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000069815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.42 
 
 		 583 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 471 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  32.25 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 518 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  30.25 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  29.2 
 
 		 516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 471 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 		 564 aa  147  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.69 
 
 		 502 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.49 
 
 		 481 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  30.2 
 
 		 493 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.06 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  29.66 
 
 		 480 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 480 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.29 
 
 		 502 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 		 478 aa  134  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 470 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 486 aa  133  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.17 
 
 		 534 aa  133  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04730  arabinose efflux permease family protein  31.18 
 
 		 529 aa  131  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 480 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.7 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 555 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 478 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27 
 
 		 478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  33.68 
 
 		 503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.82 
 
 		 478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27 
 
 		 484 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  30.12 
 
 		 488 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3121  major facilitator transporter  43.83 
 
 		 174 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083055  hitchhiker  0.000923816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 486 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 512 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 486 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 514 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.02 
 
 		 646 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 514 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.02 
 
 		 646 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 486 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 		 646 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 486 aa  123  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2962  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 462 aa  123  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.88 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.75 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.89 
 
 		 524 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2521  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 497 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.56 
 
 		 475 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 493 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  32.74 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 509 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 493 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 517 aa  120  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 493 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 630 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 		 504 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 520 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.46 
 
 		 502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 507 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 		 525 aa  117  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 484 aa  117  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 519 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>