More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4798 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
518 aa  1022    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.17 
 
 
534 aa  309  6.999999999999999e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.34 
 
 
521 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4511  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.1 
 
 
532 aa  287  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0561268  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4579  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 
531 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.25 
 
 
522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.93 
 
 
532 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  35.71 
 
 
534 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.05 
 
 
488 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.91 
 
 
528 aa  223  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.85 
 
 
489 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.59 
 
 
504 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1374  multidrug resistance protein B  31.96 
 
 
452 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.394355  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.25 
 
 
467 aa  206  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1434  MFS family transporter  31.72 
 
 
452 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.02 
 
 
502 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  34.59 
 
 
470 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.68 
 
 
508 aa  200  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  34.53 
 
 
497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.68 
 
 
480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0782  multidrug resistance protein B  30.89 
 
 
520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.63 
 
 
540 aa  197  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.75 
 
 
522 aa  196  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.66 
 
 
475 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.92 
 
 
469 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.53 
 
 
763 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.09 
 
 
489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34 
 
 
478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.41 
 
 
520 aa  190  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.19 
 
 
478 aa  189  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.44 
 
 
472 aa  189  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1215  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.34 
 
 
477 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 
487 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.31 
 
 
496 aa  187  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 
468 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  33.66 
 
 
490 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 
534 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
510 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.06 
 
 
534 aa  186  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 
491 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.42 
 
 
509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.43 
 
 
520 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 
485 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34 
 
 
498 aa  183  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.2 
 
 
583 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.54 
 
 
508 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.6 
 
 
512 aa  182  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.83 
 
 
493 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.08 
 
 
626 aa  182  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.41 
 
 
524 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.71 
 
 
627 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.96 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.66 
 
 
546 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4871  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 
517 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 
527 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.17 
 
 
583 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.86 
 
 
509 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 
520 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.07 
 
 
682 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.07 
 
 
682 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.85 
 
 
488 aa  178  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.63 
 
 
511 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.29 
 
 
788 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  34.25 
 
 
481 aa  177  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33 
 
 
487 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.07 
 
 
682 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.84 
 
 
539 aa  177  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 
646 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 
646 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.67 
 
 
558 aa  177  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
478 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.49 
 
 
519 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  34.84 
 
 
483 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
484 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 
646 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.41 
 
 
466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.3 
 
 
469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.65 
 
 
494 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.94 
 
 
479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.58 
 
 
505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.22 
 
 
579 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.37 
 
 
502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.18 
 
 
499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  32.77 
 
 
528 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 
478 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  35.18 
 
 
501 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.58 
 
 
477 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.9 
 
 
529 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.42 
 
 
478 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.33 
 
 
493 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.47 
 
 
530 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.472299  hitchhiker  0.00171027 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.23 
 
 
542 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.47 
 
 
757 aa  171  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 
474 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  31.05 
 
 
511 aa  171  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.61 
 
 
697 aa  171  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.75 
 
 
553 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
524 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.44 
 
 
505 aa  170  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.13 
 
 
515 aa  170  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>