More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1125 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  100 
 
 		 462 aa  912    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.76 
 
 		 475 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.23 
 
 		 475 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.67 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.76 
 
 		 493 aa  270  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.62 
 
 		 482 aa  269  8.999999999999999e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.08 
 
 		 482 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.59 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.87 
 
 		 465 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.97 
 
 		 477 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.66 
 
 		 477 aa  263  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.71 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 		 461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 416 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.95 
 
 		 478 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.31 
 
 		 483 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.73 
 
 		 500 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 478 aa  229  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  32.59 
 
 		 458 aa  226  8e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  33.99 
 
 		 457 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  33.99 
 
 		 457 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.06 
 
 		 496 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  33.74 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.3 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  33.74 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.95 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.59 
 
 		 501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 455 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 455 aa  216  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 455 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  33.26 
 
 		 492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 		 497 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 455 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 455 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 480 aa  213  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.45 
 
 		 493 aa  212  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.56 
 
 		 474 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.11 
 
 		 483 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 455 aa  210  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 455 aa  210  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.57 
 
 		 534 aa  209  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 		 457 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.17 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 		 457 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.77 
 
 		 474 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.2 
 
 		 502 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 		 457 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 		 457 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 455 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 455 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  33.5 
 
 		 473 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 459 aa  206  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.02 
 
 		 505 aa  206  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 498 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 491 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 484 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  31.93 
 
 		 457 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.38 
 
 		 522 aa  203  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 		 528 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.6 
 
 		 529 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.69 
 
 		 471 aa  203  5e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.9 
 
 		 540 aa  203  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 459 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.76 
 
 		 478 aa  202  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.46 
 
 		 522 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1309  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 455 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 487 aa  200  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 596 aa  200  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 573 aa  200  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 472 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 589 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  32.05 
 
 		 465 aa  197  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  28.82 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 570 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.7 
 
 		 495 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.38 
 
 		 504 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 		 495 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2030  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 474 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.275978  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  28.3 
 
 		 474 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>