More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3271 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1651  major facilitator transporter  67.81 
 
 		 641 aa  753    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695517  normal  0.0730929 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  59.39 
 
 		 582 aa  666    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 570 aa  1123    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2306  major facilitator superfamily MFS_1  60.44 
 
 		 581 aa  676    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.434674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0726  major facilitator superfamily transporter  56.35 
 
 		 576 aa  617  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13994 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3504  major facilitator superfamily MFS_1  54.73 
 
 		 578 aa  585  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3539  major facilitator superfamily MFS_1  52.12 
 
 		 608 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371134  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0565  major facilitator transporter  56.07 
 
 		 587 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0577  major facilitator superfamily transporter  56.07 
 
 		 587 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.410817  decreased coverage  0.00469629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0555  major facilitator transporter  56.07 
 
 		 587 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2321  major facilitator superfamily MFS_1  52.3 
 
 		 582 aa  548  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1098  major facilitator superfamily MFS_1  53.94 
 
 		 591 aa  547  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.948323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1554  major facilitator transporter  52.12 
 
 		 610 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  50.55 
 
 		 573 aa  530  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  48.31 
 
 		 589 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 596 aa  496  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3485  multidrug efflux protein  45.99 
 
 		 592 aa  488  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.160972 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1280  major facilitator transporter  48.11 
 
 		 562 aa  474  1e-132  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0049  major facilitator transporter  44.38 
 
 		 560 aa  461  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1253  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 562 aa  457  1e-127  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0518  major facilitator superfamily MFS_1  45.42 
 
 		 567 aa  450  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0084  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 589 aa  351  2e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0483176  normal  0.0703431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.58 
 
 		 482 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.63 
 
 		 486 aa  283  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.21 
 
 		 487 aa  256  8e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 477 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.64 
 
 		 465 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.98 
 
 		 471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1641  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 486 aa  195  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 		 456 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.14 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.04 
 
 		 493 aa  191  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 		 474 aa  187  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.26 
 
 		 522 aa  184  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  33.1 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.33 
 
 		 474 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.71 
 
 		 469 aa  180  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  32.4 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.51 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.08 
 
 		 461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 		 493 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.1 
 
 		 478 aa  174  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 465 aa  174  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  31.91 
 
 		 465 aa  173  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.3 
 
 		 475 aa  172  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.24 
 
 		 495 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.86 
 
 		 477 aa  170  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.7 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.52 
 
 		 483 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.65 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.03 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 487 aa  169  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.22 
 
 		 484 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.68 
 
 		 500 aa  166  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 501 aa  164  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  30.04 
 
 		 508 aa  164  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 467 aa  163  7e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.76 
 
 		 478 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 		 522 aa  160  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 482 aa  160  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.72 
 
 		 477 aa  160  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.6 
 
 		 504 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.28 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.16 
 
 		 522 aa  157  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.31 
 
 		 528 aa  156  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 		 478 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.27 
 
 		 528 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  29.19 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 		 525 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 502 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.24 
 
 		 510 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.75 
 
 		 505 aa  153  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 502 aa  153  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  32.13 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.83 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.39 
 
 		 512 aa  150  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5625  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.38 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.5 
 
 		 534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.25 
 
 		 467 aa  146  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 466 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.69 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.27 
 
 		 545 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  26.22 
 
 		 534 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>