More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0599 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  100 
 
 
467 aa  916    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  53.45 
 
 
492 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  51.21 
 
 
456 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  52.09 
 
 
487 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  51.55 
 
 
472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  50.33 
 
 
456 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  50.77 
 
 
456 aa  428  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.44 
 
 
474 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  49.12 
 
 
465 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  48.67 
 
 
465 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  52.42 
 
 
462 aa  413  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  48.58 
 
 
466 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  50.55 
 
 
465 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  49.68 
 
 
462 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  43.67 
 
 
461 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  42 
 
 
474 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  42.64 
 
 
475 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
453 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  41.94 
 
 
458 aa  315  9e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  37.42 
 
 
467 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 
446 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  36.98 
 
 
479 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 
466 aa  293  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  33.04 
 
 
463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  37.14 
 
 
453 aa  281  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 
497 aa  279  7e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.81 
 
 
475 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  36.27 
 
 
467 aa  269  7e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  35.57 
 
 
469 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.21 
 
 
474 aa  249  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.04 
 
 
465 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 
459 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.54 
 
 
477 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.31 
 
 
456 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 
477 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.7 
 
 
475 aa  216  8e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.39 
 
 
522 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.43 
 
 
461 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.57 
 
 
482 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.56 
 
 
471 aa  199  9e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.84 
 
 
483 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  33.33 
 
 
462 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.5 
 
 
487 aa  196  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.98 
 
 
486 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 
482 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.59 
 
 
501 aa  192  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.55 
 
 
478 aa  192  9e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.07 
 
 
500 aa  191  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0390  hypothetical protein  29.38 
 
 
526 aa  190  5e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00612987  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.59 
 
 
482 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.72 
 
 
478 aa  189  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.36 
 
 
483 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.23 
 
 
477 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.04 
 
 
478 aa  187  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 
460 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 
496 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.85 
 
 
534 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.2 
 
 
493 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.73 
 
 
509 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.63 
 
 
493 aa  179  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  31.58 
 
 
470 aa  179  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.9 
 
 
493 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.75 
 
 
495 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.16 
 
 
505 aa  177  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
476 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 
482 aa  176  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.63 
 
 
497 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.32 
 
 
522 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 
504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.51 
 
 
494 aa  173  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.65 
 
 
512 aa  173  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.47 
 
 
504 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 
495 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  31.97 
 
 
477 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  31.48 
 
 
477 aa  171  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  29.31 
 
 
490 aa  170  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  30 
 
 
462 aa  170  5e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 
485 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.65 
 
 
498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.94 
 
 
467 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  30.34 
 
 
470 aa  167  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 
646 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 
646 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 
646 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.72 
 
 
469 aa  167  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.81 
 
 
627 aa  167  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.88 
 
 
528 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.96 
 
 
478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.23 
 
 
540 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.9 
 
 
541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.96 
 
 
478 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.96 
 
 
484 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.99 
 
 
502 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.69 
 
 
502 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.08 
 
 
480 aa  163  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.37 
 
 
626 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1354  putative export protein  31.44 
 
 
498 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338095  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2962  major facilitator transporter  31.41 
 
 
462 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.05 
 
 
546 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.23 
 
 
519 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0126419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>