More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0483 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  100 
 
 		 525 aa  999    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 525 aa  999    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  73.12 
 
 		 535 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  100 
 
 		 525 aa  999    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  75 
 
 		 533 aa  716    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  51.64 
 
 		 528 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  49.59 
 
 		 509 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  49.8 
 
 		 516 aa  402  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  51.02 
 
 		 554 aa  392  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.85 
 
 		 537 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  49.69 
 
 		 508 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  48.72 
 
 		 555 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  53.32 
 
 		 513 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  50.95 
 
 		 524 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  45.79 
 
 		 528 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  48.69 
 
 		 517 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  46.59 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  49.09 
 
 		 505 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 518 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  46.01 
 
 		 517 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  45.31 
 
 		 524 aa  364  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  47.38 
 
 		 588 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 532 aa  361  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  48.61 
 
 		 521 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 526 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  45.75 
 
 		 562 aa  348  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  44.75 
 
 		 509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 		 529 aa  335  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  44.99 
 
 		 575 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  47.64 
 
 		 502 aa  333  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  44.52 
 
 		 513 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 536 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 584 aa  326  7e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  45.07 
 
 		 501 aa  325  9e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 509 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 		 503 aa  324  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  46.82 
 
 		 496 aa  323  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  45.92 
 
 		 517 aa  323  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  43.42 
 
 		 514 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 		 516 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 		 601 aa  321  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  46.31 
 
 		 481 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  44.57 
 
 		 539 aa  319  9e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  47.97 
 
 		 536 aa  318  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  47.6 
 
 		 528 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 558 aa  317  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 		 541 aa  315  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  42.86 
 
 		 508 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 		 521 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 504 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  43.31 
 
 		 553 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  44.61 
 
 		 490 aa  313  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  41.7 
 
 		 511 aa  313  4.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 		 500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 		 513 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 		 500 aa  307  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  43.59 
 
 		 516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  48.99 
 
 		 563 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  43.79 
 
 		 509 aa  301  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  41.09 
 
 		 535 aa  299  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 540 aa  297  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 514 aa  296  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 495 aa  296  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 		 506 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  43.95 
 
 		 503 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  43.33 
 
 		 514 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 511 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  41.9 
 
 		 501 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  39.34 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  45.19 
 
 		 477 aa  286  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 501 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  40.85 
 
 		 510 aa  282  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  39.88 
 
 		 492 aa  279  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.02 
 
 		 525 aa  279  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  39.68 
 
 		 495 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  39.68 
 
 		 495 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  39.68 
 
 		 495 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  39.68 
 
 		 495 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  39.68 
 
 		 495 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  39.88 
 
 		 494 aa  276  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  38.98 
 
 		 516 aa  276  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  39.84 
 
 		 513 aa  274  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 		 497 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 		 528 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  39.38 
 
 		 519 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.94 
 
 		 534 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 520 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.75 
 
 		 532 aa  261  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 		 519 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.15 
 
 		 520 aa  250  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.97 
 
 		 538 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.63 
 
 		 503 aa  247  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 		 507 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  41.2 
 
 		 516 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 509 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  39.53 
 
 		 501 aa  242  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 594 aa  239  9e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.56 
 
 		 607 aa  239  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.96 
 
 		 522 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  43.8 
 
 		 524 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>