More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0762 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  76.39 
 
 
519 aa  683    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  100 
 
 
532 aa  1013    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  57.37 
 
 
516 aa  517  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  52.39 
 
 
509 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  59.08 
 
 
524 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  55.98 
 
 
505 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 
528 aa  441  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  51.08 
 
 
554 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  50.2 
 
 
588 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  47.72 
 
 
517 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  44.56 
 
 
528 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  42.57 
 
 
524 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  48.42 
 
 
513 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  47.79 
 
 
525 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  47.79 
 
 
525 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  47.79 
 
 
525 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  45.51 
 
 
521 aa  369  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  44.65 
 
 
555 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  45.17 
 
 
533 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  42 
 
 
529 aa  352  8e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  45.14 
 
 
501 aa  352  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.97 
 
 
537 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  44.01 
 
 
526 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  44.04 
 
 
508 aa  343  5.999999999999999e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 
541 aa  342  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 
562 aa  342  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 
518 aa  341  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  42.92 
 
 
509 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  45.83 
 
 
535 aa  336  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  43.4 
 
 
584 aa  336  7.999999999999999e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 
513 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 
535 aa  326  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  45.55 
 
 
481 aa  326  6e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 
521 aa  325  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  47.71 
 
 
536 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 
517 aa  324  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  41.18 
 
 
536 aa  323  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  44.03 
 
 
540 aa  323  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 
539 aa  319  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  43.43 
 
 
509 aa  317  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  42.2 
 
 
558 aa  316  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  45.82 
 
 
563 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 
496 aa  313  5.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  41.77 
 
 
575 aa  310  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 
601 aa  309  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 
553 aa  309  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 
516 aa  306  8.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  42.43 
 
 
508 aa  303  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  37.5 
 
 
509 aa  302  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  44.63 
 
 
477 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  43.27 
 
 
506 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  44.59 
 
 
502 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  39.02 
 
 
514 aa  293  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  42.95 
 
 
513 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  38.49 
 
 
503 aa  286  9e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  44.75 
 
 
528 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  42.13 
 
 
517 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  37.55 
 
 
490 aa  283  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 
497 aa  277  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 
511 aa  277  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  43.98 
 
 
528 aa  276  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 
514 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 
516 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  43.58 
 
 
524 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  40.75 
 
 
503 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  37.26 
 
 
504 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  36.32 
 
 
494 aa  259  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 
510 aa  256  6e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  36.03 
 
 
495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  36.03 
 
 
495 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  36.38 
 
 
495 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  36.03 
 
 
495 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  35.82 
 
 
495 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  36.75 
 
 
495 aa  252  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  39.56 
 
 
519 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 
511 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  38.88 
 
 
514 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 
500 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 
500 aa  239  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  38.8 
 
 
513 aa  239  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.45 
 
 
538 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  37.42 
 
 
509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 
520 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.83 
 
 
534 aa  233  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  35.12 
 
 
516 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  36.36 
 
 
501 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 
516 aa  231  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  33 
 
 
500 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.16 
 
 
520 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.12 
 
 
525 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  34.91 
 
 
492 aa  226  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  37.97 
 
 
501 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  37.63 
 
 
501 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.53 
 
 
532 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.68 
 
 
522 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.96 
 
 
503 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  35.69 
 
 
594 aa  213  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 
523 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.33 
 
 
528 aa  210  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 
507 aa  210  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>