More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3381 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  100 
 
 		 466 aa  895    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  56.59 
 
 		 476 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  56.84 
 
 		 503 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  57.61 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  57.31 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2004  major facilitator superfamily MFS_1  57.53 
 
 		 476 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0685608 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1601  major facilitator transporter  51.59 
 
 		 488 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1318  major facilitator superfamily MFS_1  51.47 
 
 		 474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2367  major facilitator transporter  53.37 
 
 		 478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 414 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  42.76 
 
 		 462 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 411 aa  282  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  43.05 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.91 
 
 		 483 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4261  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.861934 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.39 
 
 		 500 aa  233  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.78 
 
 		 477 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.91 
 
 		 475 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.4 
 
 		 456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.74 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.19 
 
 		 483 aa  189  8e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.8 
 
 		 478 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.41 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 482 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.5 
 
 		 475 aa  180  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.1 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.61 
 
 		 464 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.462732  normal  0.495513 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 464 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.43 
 
 		 496 aa  177  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.27 
 
 		 480 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 457 aa  173  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 457 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 455 aa  173  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 457 aa  173  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 455 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 457 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  31.82 
 
 		 457 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 455 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 445 aa  173  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  31.82 
 
 		 457 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  31.82 
 
 		 457 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  31.82 
 
 		 457 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.57 
 
 		 484 aa  172  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  29.88 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 488 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  31.49 
 
 		 474 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.36 
 
 		 522 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.1 
 
 		 478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  29.17 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  29.93 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 		 540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.48 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.73 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2289  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00392793  hitchhiker  0.000728467 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.61 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 573 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.02 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.63 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.25 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.19 
 
 		 539 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 455 aa  161  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 466 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  34.92 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  28.37 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.24 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 483 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 483 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.08 
 
 		 471 aa  156  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 461 aa  157  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  30.79 
 
 		 458 aa  156  6e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 476 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  31.58 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.77 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  31.41 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.94 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 		 697 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.94 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.69 
 
 		 520 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.11 
 
 		 549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  31.11 
 
 		 531 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  31.11 
 
 		 549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  31.11 
 
 		 531 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>