More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1430 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 497 aa  969    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  56.55 
 
 		 467 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 		 466 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  43.21 
 
 		 469 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  40.04 
 
 		 492 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 465 aa  335  7.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  39.74 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  41.19 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  44.32 
 
 		 453 aa  329  9e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 487 aa  325  9e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 475 aa  325  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 472 aa  316  5e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 456 aa  316  8e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.58 
 
 		 474 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 456 aa  309  8e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 458 aa  290  6e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  40.65 
 
 		 459 aa  286  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 461 aa  282  9e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 463 aa  265  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 462 aa  262  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  33.12 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 479 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.3 
 
 		 475 aa  229  9e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.24 
 
 		 474 aa  217  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 467 aa  216  9e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.05 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.53 
 
 		 475 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.34 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 460 aa  196  9e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.25 
 
 		 493 aa  195  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 		 483 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 		 477 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.17 
 
 		 486 aa  190  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.28 
 
 		 471 aa  190  5e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.73 
 
 		 483 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 482 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.73 
 
 		 528 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.77 
 
 		 487 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.84 
 
 		 461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.42 
 
 		 493 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 		 532 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.01 
 
 		 500 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.96 
 
 		 522 aa  176  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.06 
 
 		 478 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.71 
 
 		 456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 596 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.2 
 
 		 487 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.15 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 480 aa  170  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.56 
 
 		 496 aa  170  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.05 
 
 		 489 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.64 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5625  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.19 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.14 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.97 
 
 		 627 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.17 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.82 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.97 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1015  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.817522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 		 493 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  30.38 
 
 		 462 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 		 504 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 457 aa  163  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  31.41 
 
 		 457 aa  163  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 457 aa  163  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 457 aa  163  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 457 aa  163  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.68 
 
 		 534 aa  163  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 476 aa  163  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 459 aa  163  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  31.18 
 
 		 457 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.45 
 
 		 505 aa  163  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  31.18 
 
 		 457 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 491 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.52 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.01 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  29.04 
 
 		 508 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  31.18 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.88 
 
 		 534 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 573 aa  160  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 462 aa  160  6e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>