More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1452 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  100 
 
 		 475 aa  935    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  49.33 
 
 		 492 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  46.04 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  46.48 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  46.57 
 
 		 487 aa  395  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  46.04 
 
 		 465 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.44 
 
 		 474 aa  376  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  45.15 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  42.01 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  43.57 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  47.36 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 456 aa  359  5e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 467 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  42.63 
 
 		 497 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  45.37 
 
 		 462 aa  330  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  39.37 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  41.07 
 
 		 469 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  41.09 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  39.34 
 
 		 453 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 		 466 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 463 aa  293  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 458 aa  293  5e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 479 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 467 aa  249  5e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  35.67 
 
 		 459 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.53 
 
 		 475 aa  224  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 		 474 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.33 
 
 		 465 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.9 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0390  hypothetical protein  29.36 
 
 		 526 aa  199  9e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00612987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  33.65 
 
 		 462 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 477 aa  196  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.99 
 
 		 456 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 488 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.08 
 
 		 483 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  32.37 
 
 		 464 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 475 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.11 
 
 		 522 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.39 
 
 		 483 aa  186  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.3 
 
 		 478 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 		 477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 477 aa  179  5.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.81 
 
 		 500 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.1 
 
 		 487 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.75 
 
 		 478 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.79 
 
 		 471 aa  176  8e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.09 
 
 		 457 aa  176  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 455 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.96 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 455 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 455 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  29.53 
 
 		 490 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.23 
 
 		 493 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.96 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.49 
 
 		 486 aa  173  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.13 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 498 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 455 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  31.62 
 
 		 457 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1309  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.12 
 
 		 504 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  28.97 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 460 aa  167  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 459 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.53 
 
 		 461 aa  163  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 472 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 453 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 453 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 491 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.17 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 457 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.14 
 
 		 482 aa  161  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.18 
 
 		 478 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.02 
 
 		 467 aa  160  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.87 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 445 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  29.26 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.25 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>